CCBR/ASPEN
Vedi su GitHubCCBR pipeline for preliminary QC, peak calling, differential chromatin accessibility analysis with ATACseq datasets 🌲
- Stelle
- 1
- Fork
- 2
- Issue aperte per principianti
- 0
- Issue indicizzate
- 19
- Merge medio
- 22h 39m
- PR unite (30g)
- 7
- Lingua principale
- Python
- Licenza
- MIT
- Ultimo push su GitHub
- 17/9/2026
- Ultima indicizzazione
- 20/9/2026
- Guida per i contributori
- Guida per i contributori
- Codice di condotta
- Nessun codice di condotta
- Label per principianti
- Nessuna label per principianti indicizzata
Caricamento delle issue
-
ASPEN
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
-
Snakemake jobs killed by SLURM (timeout/OOM/cancel) are never detected — pipeline hangs indefinitely ApertaASPEN enhancement generated-by-AI
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 72/100
-
ASPEN documentation
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 70/100
-
ASPEN enhancement
-
ASPEN bug
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100
-
Add support for GRCm39 ApertaASPEN enhancement
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100
-
ASPEN bug
-
Create `chromVar` docker ApertaASPEN
-
add `chromvar` ApertaASPEN enhancement
-
add `ataqv` support ApertaASPEN enhancement
-
ASPEN enhancement
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
-
ASPEN
-
ASAP: Deeptools peaks ApertaASPEN enhancement MediumPriority