CCBR/ASPEN
CCBR pipeline for preliminary QC, peak calling, differential chromatin accessibility analysis with ATACseq datasets 🌲
¿Es CCBR/ASPEN apto para principiantes?
Hemos visto muy pocos pull requests recientes de colaboradores externos en CCBR/ASPEN para saber con qué frecuencia se fusionan. Ahora mismo hay 1 issue apto para principiantes abierto.
- Estrellas
- 1
- Forks
- 2
- Issues abiertos para principiantes
- 1
- Issues indexados
- 22
- Merge medio
- 1 d 2 h
- PR fusionados (30 d)
- 8
- Lenguaje dominante
- Python
- Licencia
- MIT
- Último push a GitHub
- 25/9/2026
- Última indexación
- 20/9/2026
- Guía de contribución
- Guía de contribución
- Código de conducta
- Sin código de conducta
- Etiquetas para principiantes
- Sin etiquetas para principiantes indexadas
Cómo contribuir a CCBR/ASPEN
- Lee primero la guía de contribución: explica cómo quieren los mantenedores que se propongan, prueben y revisen los cambios.
- Tus contribuciones se publicarán bajo la licencia MIT del proyecto.
- Elige el issue abierto apto para principiantes de abajo y comenta que quieres trabajar en él antes de empezar.
Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha
-
ASPEN
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 90/100
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ASPEN
Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100
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Add support for GRCm39AbiertoASPEN enhancement
Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100
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SINGULARITY CACHE DIR sing file namesQuizá libre de nuevo @kopardev la tomó hace 581 días y no hay ningún pull request abierto. AbiertoASPEN bug
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Create `chromVar` dockerQuizá libre de nuevo @kopardev la tomó hace 581 días y no hay ningún pull request abierto. AbiertoASPEN
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add `chromvar`Quizá libre de nuevo @kopardev la tomó hace 581 días y no hay ningún pull request abierto. AbiertoASPEN enhancement
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add `ataqv` supportQuizá libre de nuevo @kopardev la tomó hace 581 días y no hay ningún pull request abierto. AbiertoASPEN enhancement
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Need to add single-end optionAbiertoASPEN enhancement
Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100
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"consensus" peaks are generated even when samples have only 1 replicateQuizá libre de nuevo @kopardev la tomó hace 1041 días y no hay ningún pull request abierto. AbiertoASPEN
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ASAP: Deeptools peaksQuizá libre de nuevo @kopardev la tomó hace 1390 días y no hay ningún pull request abierto. AbiertoASPEN enhancement MediumPriority