Proprietario
AllenNeuralDynamics
239 repository indicizzati · Vedi su GitHub
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aind-ephys-pipeline
AIND pipeline for processing extracellular electrophysiology data
Nextflow · 41 stelle
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aind-data-schema
A library that defines AIND data schema and validates JSON.
Python · 34 stelle
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openscope-community-predictive-processing
This repository serves as a hub for community-driven contributions, documentation, and project tracking of the OpenScope Predictive Proce...
Python · 26 stelle
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aind-ephys-spikesort-kilosort25-full
CodeOcean capsule for full electrophysiology analysis pipeline using Kilosort2.5 via SpikeInterface.
Python · 14 stelle
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aind-large-scale-cellpose
Large-scale cell segmentation with cellpose.
Python · 10 stelle
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Rhapso
An open-source Python toolkit for large-scale fluorescence microscopy data alignment and fusion.
Python · 9 stelle
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dynamic-foraging-task
Bonsai/Harp workflow for Dynamic Foraging with Python GUI for visualization and control
Python · 7 stelle
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aind-smartspim-pipeline
Repository that hosts the SmartSPIM pipeline code
Nextflow · 7 stelle
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TigerASI
a lightweight python interface for ASI brand Tiger Controllers
Python · 5 stelle
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wavpack-numcodecs
Numcodecs implementation of the WavPack audio codec
C · 5 stelle
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anivia
Fork of VGG VIA to better support annotation of animal pose images
JavaScript · 4 stelle
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harp.device.treadmill-driver
0326: a Harp-compatible device for controlling an instrumented mouse treadmill
Jupyter Notebook · 4 stelle
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voxel-classic
General purpose microscope control repository
Python · 4 stelle
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view
Model/View for exa-spim
Python · 4 stelle
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harp.device.lickety-split
0360: an ephys-compliant capacitive lick detector
C++ · 4 stelle
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runze-control
Python Driver for Aurora Pro Scientific (aka Runze Fluid) syringe pumps
Python · 4 stelle
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pinpoint
Next-generation in vivo electrophysiology planning and automation tool.
TypeScript · 4 stelle
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parallax
Automatic detection of probe position from multiple camera views
Python · 4 stelle
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aind-SmartSPIM-segmentation
segmentation module for SmartSPIM cloud pipeline
Python · 4 stelle
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aind-smartspim-stitch
Stitching and fusion pipeline in the cloud
Python · 4 stelle
- 219 altri repository si trovano su Vedi su GitHub
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AllenNeuralDynamics/aind-metadata-service#762 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 40/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100
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AllenNeuralDynamics/aind-metadata-upgrader#320 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
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AllenNeuralDynamics/harp.device.quac#121 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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AllenNeuralDynamics/dynamic-foraging-processing#111 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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Bonsai package throws error Aperta
AllenNeuralDynamics/harp.device.quac#118 · 1 commento · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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AllenNeuralDynamics/aind-ecephys-nwb#23 · 1 assegnatario ·
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AllenNeuralDynamics/one-liner#67 · 1 assegnatario ·
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AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#338 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100
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AllenNeuralDynamics/one-liner#66 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
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AllenNeuralDynamics/pinpoint#12 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100
AllenNeuralDynamics/biodata-schema#78 · 1 commento ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
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Remove process names enum Aperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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Cyclic IF Aperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 45/100
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Cohort Aperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100
AllenNeuralDynamics/aind-file-standards#88 · 1 commento ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100
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AllenNeuralDynamics/biodata-schema#67 · 1 assegnatario ·
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AllenNeuralDynamics/aind-file-standards#87 · 1 commento · 1 assegnatario ·
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AllenNeuralDynamics/aind-file-standards#86 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100
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AllenNeuralDynamics/aind-ephys-results-collector#24 · 1 assegnatario ·
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AllenNeuralDynamics/aind-ephys-visualization#27 · 1 assegnatario ·
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AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#492 · 1 assegnatario ·
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AllenNeuralDynamics/aind-file-standards#85 · 6 commenti · 1 assegnatario ·
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AllenNeuralDynamics/zombie#83 · 1 commento · 1 assegnatario ·
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AllenNeuralDynamics/aind-ephys-curation#16 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100
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AllenNeuralDynamics/aind-ephys-postprocessing#16 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 48/100
AllenNeuralDynamics/biodata-schema#66 · 2 commenti · 1 reazione ·
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Mismatch event frequency Aperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 48/100
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