AllenNeuralDynamics

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  AllenNeuralDynamics/clabe#298 · Abierto el 7/11/2026

• Sessions with extreme edge cases

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging.Packaging#104 · Abierto el 7/11/2026

• Apply thresholds to QC metrics

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  AllenNeuralDynamics/analysis-pipeline-utils#71 · Abierto el 6/11/2026

• Add AGENTS.md and developer docs

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  AllenNeuralDynamics/aind-ephys-pipeline#159 · Abierto el 6/11/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Add DANDI streaming option

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  AllenNeuralDynamics/aind-ephys-pipeline#157 · Abierto el 6/11/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• DANDI compute AIND issues

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  AllenNeuralDynamics/aind-ephys-pipeline#156 · Abierto el 6/11/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Session missing session_output.json

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging.Packaging#103 · Abierto el 6/11/2026

• Sessions missing ActiveSite Software Event

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging.Packaging#102 · Abierto el 6/11/2026

• Sessions missing GiveReward Software Event

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging.Packaging#101 · Abierto el 6/11/2026

• Sessions missing PatchStateAtReward software event

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging.Packaging#100 · Abierto el 6/11/2026

• clarify metric name fields

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  AllenNeuralDynamics/standard_morph#27 · Abierto el 6/11/2026

• Sessions missing olfactometer or lick bin file

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging.Packaging#99 · Abierto el 5/11/2026

• Sessions missing device.yml for Treadmill device

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging.Packaging#98 · Abierto el 5/11/2026

• Consider moving water valve calibration from acquisition to instrument metadata

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging#631 · 1 comentario · Abierto el 5/11/2026

• Sessions too short to package

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging.Packaging#97 · Abierto el 5/11/2026

• Rename SoftwareEvents extensions from json to jsonl

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.VrForaging#630 · Abierto el 5/11/2026

• Support OME Zarr v0.6 scenes as input to Rhapso

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  AllenNeuralDynamics/Rhapso#295 · Abierto el 5/11/2026

• Inventory and re-fuse the 2025 stitched assets whose tiles were fused at their stage positions

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  AllenNeuralDynamics/aind-smartspim-pipeline#31 · Abierto el 4/11/2026

• Left- and right-lit tiles image planes tilted 0.27–0.37° against each other, which translation-only stitching cannot fit

  Abierto

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  AllenNeuralDynamics/aind-smartspim-stitch#43 · 1 comentario · Abierto el 4/11/2026

• Every channel is fused with the stitching channel's tile transforms, but SmartSPIM1's channels sit 5–16 µm apart

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  AllenNeuralDynamics/aind-smartspim-fuse#14 · Abierto el 4/11/2026

• missing logs for test.sh failures

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  bug

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

  AllenNeuralDynamics/aind-docker-images#114 · Abierto el 4/11/2026

  Los mantenedores suelen responder en 2 días

• The BigStitcher global solve runs on defaults that keep false links and let unlinked blocks rotate

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  AllenNeuralDynamics/aind-smartspim-stitch#42 · 1 comentario · Abierto el 4/11/2026

• Explore vs Find candidate neurons

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  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 88/100

  AllenNeuralDynamics/nmcp-client#25 · Abierto el 4/11/2026

• Search published neurons tab

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  AllenNeuralDynamics/nmcp-client#24 · Abierto el 3/11/2026

• Unlock upper pydantic pin

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  AllenNeuralDynamics/aind-data-schema#1881 · Abierto el 3/11/2026

• Unhandled error in "FileSettings0Payload"

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  AllenNeuralDynamics/harp.device.quac#130 · Abierto el 3/11/2026

• Error in Bonsai AOChannelsAssignedToDI0Payload

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  AllenNeuralDynamics/harp.device.quac#129 · Abierto el 3/11/2026

• Metadata v2 compilation bypasses the schema merger and publishes assets without processing.json

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  AllenNeuralDynamics/aind-smartspim-pipeline-dispatcher#40 · Abierto el 2/11/2026

• Figure out how to handle session with multiple experiment recordings

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  AllenNeuralDynamics/aind-fip-harp-nwb-base-capsule#7 · 2 comentarios · Abierto el 2/11/2026

• Adopt nf-core folder organization

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  AllenNeuralDynamics/aind-ephys-pipeline#149 · Abierto el 2/11/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Merge behavior and Open Ephys metadata: dependency overrides and mapper alignment

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  AllenNeuralDynamics/Aind.Experiment.VrForaging#38 · Abierto el 1/11/2026

• Publish package to pypi and lower pins

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  AllenNeuralDynamics/ficus#96 · Abierto el 31/10/2026

• Analysis contribution: control CKA sensitivity to spatial sampling

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  AllenNeuralDynamics/openscope-community-predictive-processing#190 · 1 comentario · Abierto el 30/10/2026

• Store config locally with Ficus

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  AllenNeuralDynamics/prototome-web-ui#63 · Abierto el 30/10/2026

• More feedback before release into production

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  AllenNeuralDynamics/ficus#95 · Abierto el 30/10/2026

• ROI does not match on rig

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  AllenNeuralDynamics/prototome-web-ui#62 · Abierto el 29/10/2026

• e-stop should force grab token always

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

  AllenNeuralDynamics/prototome-web-ui#61 · 1 comentario · Abierto el 29/10/2026

• release write token button

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 22/100

  AllenNeuralDynamics/prototome-web-ui#60 · Abierto el 29/10/2026

• access type

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  AllenNeuralDynamics/prototome-web-ui#59 · Abierto el 29/10/2026

• keyboard shortcuts

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  AllenNeuralDynamics/nmcp-client#23 · Abierto el 29/10/2026

• Build integration tests

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  AllenNeuralDynamics/GIAnT-MATLAB#23 · 1 comentario · Abierto el 28/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 5 días

• Clarify full stack of working with multi-modal data from acquisition to NWBs

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  AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#247 · Abierto el 28/10/2026

• add platforms column to asset_basics

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  AllenNeuralDynamics/biodata-cache#70 · Abierto el 28/10/2026

• update QC view

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  AllenNeuralDynamics/nmcp-client#22 · Abierto el 28/10/2026

• fix link sharing

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  AllenNeuralDynamics/nmcp-client#21 · 1 comentario · Abierto el 27/10/2026

• bulk download improvements

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  AllenNeuralDynamics/nmcp-client#20 · 1 comentario · Abierto el 27/10/2026

• QC on upload

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  AllenNeuralDynamics/nmcp-client#19 · 1 comentario · Abierto el 27/10/2026

• change atlas annotation/coordinate system metadata

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  AllenNeuralDynamics/nmcp-client#18 · Abierto el 27/10/2026

• fix redundant ci

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  AllenNeuralDynamics/standard_morph#25 · 3 comentarios · Abierto el 27/10/2026

• Parallelize subproblem solves in SiLO/address memory leak on Linux

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  bug enhancement

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  AllenNeuralDynamics/GIAnT-MATLAB#21 · 3 comentarios · Abierto el 26/10/2026

  Los mantenedores suelen responder en 5 días