shenwei356/seqkit

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

• common, pair, split, split2: lost or changed data with exit 0, and inputs deleted by -O / -f

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  shenwei356/seqkit#620 · Abierto el 20/10/2026

• sliding, merge-slides, mutate, translate, replace: panics, lost windows and wrong output with exit 0

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  shenwei356/seqkit#619 · Abierto el 20/10/2026

• faidx, locate, amplicon, fish: wrong output, panics and lost data, often with exit 0

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

  shenwei356/seqkit#618 · Abierto el 20/10/2026

• sana and scat: crashes, and records lost or doubled with exit 0

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  shenwei356/seqkit#617 · Abierto el 20/10/2026

• watch and bam: panics, and asked output that is missing with exit 0

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  shenwei356/seqkit#616 · 3 comentarios · Abierto el 20/10/2026

• shuffle, sample, sample2, split: records lost or changed and user files deleted, with exit 0

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 56/100

  shenwei356/seqkit#615 · Abierto el 20/10/2026

• concat, head-genome, rename, range: descriptions cut or lost, rename -m overwrites, range wraps, concat -F misplaces fill (exit 0)

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

  shenwei356/seqkit#614 · Abierto el 20/10/2026

• sum: a file that fails is left out of the output, but the exit code is 0

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 54/100

  shenwei356/seqkit#613 · 1 comentario · Abierto el 19/10/2026

• convert: no range check between Phred encodings, so a wrong --from writes a broken FASTQ (exit 0)

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 82/100

  shenwei356/seqkit#612 · 1 comentario · Abierto el 19/10/2026

• seqkit pre-release binaries v2.15.0

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 8/100

  shenwei356/seqkit#608 · Abierto el 15/10/2026

• Trim a multiple sequence alignment based on a BED

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

  shenwei356/seqkit#477 · 4 comentarios · Abierto el 5/7/2024

• [feature request] seqkit subseq with --circular option?

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 28/100

  shenwei356/seqkit#475 · 4 comentarios · 1 reacción · Abierto el 28/6/2024

• Parallel decompression of FASTQ files generated by seqkit

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  enhancement

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

  shenwei356/seqkit#443 · 5 comentarios · Abierto el 9/3/2024

• seqkit amplicon only keeps one amplicon

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  enhancement

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

  shenwei356/seqkit#191 · 5 comentarios · Abierto el 22/2/2021

• subseq enhancement - fasta ID and comment for bed, gtf and gff

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  enhancement

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  shenwei356/seqkit#177 · 2 comentarios · 2 reacciones · Abierto el 22/1/2021