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ggtree support

Abierto
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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
35/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
r
Área
data-visualization

Línea de trabajo

Comienza con el ejemplo de R proporcionado y el punto de entrada ggplotly(), y luego sigue la advertencia de geom2trace.default() para geom_GeomTextGGtree. Se considera terminado cuando el gráfico de ggtree se convierte a Plotly sin la advertencia de un geom no implementado y sigue permitiendo hacer zoom.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Hello everyone. I wanted to plot a phylogeny tree thanks to ggtree R package. Yet, I have too many species (around 1000) and the graph is unreadable. Thus, I wanted to convert the plot into plotly format to be able to zoom in. But I got this error message (see below).

Thank you for your help !

tree = read.tree("ressources/phylogeny_tree.tree")
p <- ggtree(tree, layout = "circular") + 
  geom_tiplab(size = 2) + 
  theme_tree2()  
ggplotly(p)

5: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
  geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
  If you'd like to see this geom implemented,
  Please open an issue with your example code at
  https://github.com/ropensci/plotly/issues
6: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
  geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
  If you'd like to see this geom implemented,
  Please open an issue with your example code at
  https://github.com/ropensci/plotly/issues
Lenguaje dominante
R
Estrellas
2.7k
Forks
641
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

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Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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