Switch local/module GTF2BED to nf-core/module BEDOPS_GTF2BED

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Evaluación

Dificultad
3/5
Tiempo estimado
1-2 días
Aptitud para principiantes
48/100
Tipo de issue
Refactorización
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Área
bioinformatics

Línea de trabajo

Comienza localizando el módulo GTF2BED local y todas las referencias de los workflows a él, y compáralos después con el módulo nf-core BEDOPS_GTF2BED de la página enlazada. La tarea estará terminada cuando el pipeline use el módulo de nf-core en lugar del local y sus comprobaciones existentes de los workflows sigan pasando.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

enhancement

Potentially refactor to use the nf-core module instead of the local GTF2BED module.

See: https://nf-co.re/modules/bedops_gtf2bed/

Lenguaje dominante
Nextflow
Estrellas
245
Forks
185
Merge medio
27 d 19 h
PR fusionados (30 d)
1

Preparar el entorno

Abrir en Codespaces

Inicia el contenedor de desarrollo del proyecto en tu navegador, con tu propia cuenta de GitHub.

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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