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retrieve future expression on local machine

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Evaluación

Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Aptitud para principiantes
25/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
r
Área
distributed-systems, hpc

Línea de trabajo

Revisa el comportamiento de future.batchtools para el plan mostrado usando login, batchtools_lsf y multiprocess. Comienza con el ciclo de vida documentado de un future enviado y determina si los resultados pueden recuperarse después de que se cierre la sesión local de R o desde la máquina remota; documenta el comportamiento compatible y cualquier mecanismo de persistencia requerido.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

feature request question

Hi Henrik,

maybe that's utterly basic and the wrong place to ask, but I thought it might be of interest for more people:

Is there a way you can retrieve a future expressions in the following setup:

login <- tweak(remote, workers = "remote@remote")
bsub <- tweak(batchtools_lsf, ...)
plan(list(
    login,
    bsub,
    multiprocess
))

and I submit the following job (just an example):

y %<-% furrr::future_map_dfr(1:5, function(x){
    cores <- availableCores()
    furrr::future_map_dfr(1:5, function(x){
        tibble::tibble(x = x, 
                       nodename = Sys.info()['nodename'],
                       Sys.getpid = Sys.getpid(), 
                       availableCores = cores) 
    })
})

... let's imagine this takes an considerable amount of time and I would close my local r session in between submitting the job and its being finished.

After a login then (and rerunning the same plan again) I can't access y, neither can I access y on the remote machine in an R session. Is that possible in general?

If not, we wondered if you can save R objects somehow in an future_apply, submitted from a local machine and evaluated an a remote one?

Sorry for the very basic questions, just started to fiddle around with future.batchtools.

Cheers
Marco

Lenguaje dominante
R
Estrellas
87
Forks
10
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

Abrir la guía de contribución

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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