Unexpected failure in spectro completeness notebook
@forero ya está trabajando en esto.
Desde el 18/1/2024.
Evaluación
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Descripción
In onskydata/spectro_completeness.ipynb, the cell that begins
z = []
fba = []
exp_fba = []
target = []
zmtl = []
throws an exception when run on Perlmutter with kernel 22.2 or 23.1. The full output from the cell is:
failed for redrock file from petal 1, tileid 4117 and night 20221122
failed for redrock file from petal 5, tileid 4117 and night 20221122
failed for zmtl file from petal 1, tileid 4117 and night 20221122
failed for zmtl file from petal 5, tileid 4117 and night 20221122
failed for redrock file from petal 1, tileid 5648 and night 20220324
failed for redrock file from petal 7, tileid 8776 and night 20220104
failed for zmtl file from petal 7, tileid 8776 and night 20220104
failed for redrock file from petal 7, tileid 8777 and night 20220104
failed for zmtl file from petal 7, tileid 8777 and night 20220104
---------------------------------------------------------------------------
TypeError Traceback (most recent call last)
Cell In[6], line 45
42 print("failed for zmtl file from petal {}, tileid {} and night {}".format(petal, tileid, lastnight))
44 data_z = np.hstack(z)
---> 45 data_fba = np.hstack(fba)
46 data_exp_fba = np.hstack(exp_fba)
47 data_target = np.hstack(target)
File <__array_function__ internals>:180, in hstack(*args, **kwargs)
File /global/common/software/desi/perlmutter/desiconda/20230111-2.1.0/conda/lib/python3.10/site-packages/numpy/core/shape_base.py:343, in hstack(tup)
341 # As a special case, dimension 0 of 1-dimensional arrays is "horizontal"
342 if arrs and arrs[0].ndim == 1:
--> 343 return _nx.concatenate(arrs, 0)
344 else:
345 return _nx.concatenate(arrs, 1)
File <__array_function__ internals>:180, in concatenate(*args, **kwargs)
TypeError: invalid type promotion with structured datatype(s).
- Lenguaje dominante
- Jupyter Notebook
- Estrellas
- 62
- Forks
- 25
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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