ArrowScan to_table fails if the data is mixed between dict-encoded strings and plain strings.
Nadie ha tomado este issue todavía.
Evaluación
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Aptitud para principiantes
- 55/100
Línea de trabajo
Comienza con la reproducción mínima e inspecciona ArrowScan.to_table junto con el punto de entrada to_record_batches mostrado en el issue. Verifica cómo se combinan los batches que mezclan strings simples y valores codificados mediante diccionario. Se considera terminado cuando la reproducción se completa sin ArrowTypeError y devuelve una tabla de Arrow con la columna de strings esperada.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Apache Iceberg version
0.11.0 (latest release)
Please describe the bug 🐞
We have recently updated our functions to call the pyiceberg table.append() function with dict encoded arrow tables. Now we have in our iceberg tables mixed data from before this change, (where our data still is stored as string) and after the change, where the data is stored as dict-encoded strings.
If we now call to_arrow() of a DataScan class, on this table we get this error:
pyarrow.lib.ArrowTypeError: Unable to merge: Field col has incompatible types: string vs dictionary<values=string, indices=int32, ordered=0>
Here is a minimal example that reproduces this error:
from pyiceberg.io.pyarrow import ArrowScan
from pyiceberg.table import ALWAYS_TRUE
from pyiceberg.schema import Schema
from pyiceberg.types import NestedField
from pyiceberg.types import StringType
import pyarrow as pa
def create_scan_with_mixed_dict_encode_not_encode() -> ArrowScan:
schema = Schema(
NestedField(field_id=1, name="col", field_type=StringType(), required=False)
)
class FakeTableMetadata:
def schema(self) -> Schema:
return schema
scan = ArrowScan(table_metadata=FakeTableMetadata(),
io=object(),
projected_schema=schema,
row_filter=ALWAYS_TRUE)
def _batches_for_repro(self, _tasks):
str_values = pa.array(["a"], type=pa.string())
yield pa.record_batch([str_values], names=["col"])
yield pa.record_batch([str_values.dictionary_encode()], names=["col"])
ArrowScan.to_record_batches = _batches_for_repro
return scan
if __name__ == "__main__":
scan = create_scan_with_mixed_dict_encode_not_encode()
arrow_table = ArrowScan.to_table(scan, tasks=[])
I am happy to provide a bugfix PR, but I need a small guidance on the best approach.
One idea is to cast each batch in to_table to the arrow_schema. The more performant way is to check for each batch, if the schema is different. If they are different, then find the dict_encoded col and only cast that one to string.
Willingness to contribute
- I can contribute a fix for this bug independently
- I would be willing to contribute a fix for this bug with guidance from the Iceberg community
- I cannot contribute a fix for this bug at this time
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 1.1k
- Forks
- 589
- Merge medio
- 2 d 2 h
- PR fusionados (30 d)
- 70
Guía de contribución
No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Más de apache/iceberg-python
-
kind:bug
Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 92/100
apache/iceberg-python#4006 ·
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 78/100
apache/iceberg-python#3996 ·
-
Deletion vector bitmap count is read from the blob and used as a loop bound without validation Abiertobug
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 72/100
apache/iceberg-python#3979 ·
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 78/100
apache/iceberg-python#3885 ·
-
[Bug] PyArrowFileIO fails to propagate s3.ssl.ca-cert to pyarrow.fs.S3FileSystem tls_ca_file_path Abierto
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 76/100
apache/iceberg-python#3866 · 1 comentario ·
Todos los issues de apache/iceberg-python
Issues similares
-
bug
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 90/100
learningequality/ricecooker#747 ·
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100
BSData/horus-heresy-3rd-edition#3171 ·
-
enhancement
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 72/100
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 76/100
run-llama/llama_index#23199 ·
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 84/100
KhronosGroup/glTF-Blender-IO#2769 ·