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Add flag to toggle `"ForceAcceptedLastResort"` resolution

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Evaluación

Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Aptitud para principiantes
35/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
python
Área
data

Línea de trabajo

Empieza siguiendo el comportamiento de resolución de ForceAcceptedLastResort en el pipeline y cómo los taxones sin coincidencia entran en el bucket "unresolved". Determina cómo debería afectar un toggle a las etiquetas de fallback proporcionadas por la fuente y si la coincidencia por nombres comunes está dentro del alcance. Se considera terminado cuando el comportamiento elegido es explícito y distingue de forma coherente entre taxones resueltos y no resueltos.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

edge case

We may not always want to force unmatched taxonomic labels to be resolved to the source-provided labels. It could be helpful to push these into the "unresolved" bucket for potential review.

Example from TreeOfLife-10M re-resolution:

{"uuid": "1375e525-845c-492a-9a9c-5a4476750ec7", 
"source_id": "30030699", 
"scientific_name": "Giant stick insect", 
"phylum": null, 
"class": null, 
"order": null, 
"family": null, 
"genus": "Giant", 
"species": "Giant stick insect", 
"kingdom": null, 
"common_name": "Giant stick insect"}

This is an example of improperly labeled source data that was fed into the pipeline. Since there was no resolution profile to which it could match, this was forced through to resolve as provided by the source. In this case, we would not want such a resolution to be considered "resolved".

Alternatively (or additionally), we could consider a common-name match resolution option (all unresolved taxa from TreeOfLife-10M have common name labels, but no other taxa).

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
19
Forks
0
Sin PR fusionados en 30 d

Preparar el entorno

Aún no hemos revisado los archivos de configuración de este proyecto. Empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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