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Allow user to specify R0 (in lieu of doubling time)

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Evaluación

Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Aptitud para principiantes
25/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
python
Área
backend

Línea de trabajo

Comienza localizando la entrada y el cálculo existentes del tiempo de duplicación descritos en el issue. Determina dónde una entrada de R0 reemplazaría o complementaría esa entrada y, a continuación, verifica que el modelo produzca la relación indicada para gamma de 1/14 días y un tiempo de duplicación de cuatro días. Se considera terminado cuando la opción de entrada compatible y el cálculo resultante estén claros y validados.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

enhancement hospital-request python wontfix

Calculation (extends "more info about this tool"):

We can compute the implicit $R_0$ from our doubling time inputs and our assumed duration of infectiousness $(1/\gamma)$. Since $R_0$ is the number of additional individuals infected by each infected individual when $I << S$, we can compute the growth rate $g$ as a function of $R_0$ and $\gamma$:
$$g = \gamma R_0 $$
From our previous equation for $g$, we can substitute and rearrange to find:
$$R_0 = (2^{1/T_d} - 1)/\gamma$$

So, for our $\gamma$ of 1/14 days, a doubling time of 4 days corresponds to an $R_0$ of 2.65.

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
210
Forks
153
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

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Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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