Hacktoberfest 2026: los issues que los mantenedores marcaron para octubre, abiertos y aptos para principiantes. Explorar issues de Hacktoberfest

AlexsLemonade/training-modules

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A collection of modules that are combined into 1-5 day workshops on computational topics for the childhood cancer research community.

¿Es AlexsLemonade/training-modules apto para principiantes?

Los mantenedores de AlexsLemonade/training-modules suelen responder a un pull request en 1 día. Ahora mismo hay 5 issues aptos para principiantes abiertos.

Estrellas
79
Forks
35
Issues abiertos para principiantes
5
Issues indexados
53
Merge medio
23 h 38 min
PR fusionados (30 d)
29
Lenguaje dominante
HTML
Licencia
Sin datos de licencia
Último push a GitHub
3/10/2026
Última indexación
14/9/2026
Guía de contribución
Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes
Sin etiquetas para principiantes indexadas

Cómo contribuir a AlexsLemonade/training-modules

  1. Lee primero la guía de contribución: explica cómo quieren los mantenedores que se propongan, prueben y revisen los cambios.
  2. Incluye un Dockerfile o un archivo de Docker Compose, así que puedes ejecutarlo sin instalar todas sus herramientas.
  3. Elige uno de los 5 issues abiertos aptos para principiantes de abajo y comenta que quieres trabajar en él antes de empezar.
Para principiantes Todo
Abierto Todos

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

  • restrict threads for RCTD
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 1/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 65/100

    AlexsLemonade/training-modules#1112 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add C8 to notebooks that introduce msigbdr
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 70/100

    AlexsLemonade/training-modules#1016 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Swap size -> linewidth
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 72/100

    AlexsLemonade/training-modules#1015 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Write slides for spatial workshop
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    Epic

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 38/100

    AlexsLemonade/training-modules#1014 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • 2026 Intro scRNA-seq workshop fixes
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 72/100

    AlexsLemonade/training-modules#997 · 3 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Potentially update GSEA notebook gmt file handling
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100

    AlexsLemonade/training-modules#991 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Expand data maintenance documentation
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    AlexsLemonade/training-modules#973 · 2 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Update external workshop instructions for new server
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 64/100

    AlexsLemonade/training-modules#970 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Update spatial cheatsheet links to point to rdrr
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 64/100

    AlexsLemonade/training-modules#963 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Update how we install Python packages in Docker
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    AlexsLemonade/training-modules#885 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Ignore data files for gitignore.user
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#799 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Consider changing default branch to `main`
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#750 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • What is the future of rdrr?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    AlexsLemonade/training-modules#706 · 3 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Cheatsheets reorganized by topic
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    nice to have

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    AlexsLemonade/training-modules#683 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Nice to have for scAdvanced: resource document covering differential cell type abundance
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    AlexsLemonade/training-modules#604 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Consider a separate directory for reference files
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    AlexsLemonade/training-modules#557 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Update links in RNA-seq, pathway-analysis, and machine-learning cheatsheets
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 Medio día Aptitud para principiantes 55/100

    AlexsLemonade/training-modules#528 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add rendering of module cheatsheets to make-live workflow
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

    AlexsLemonade/training-modules#523 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • DESeqDatasetFromMatrix() doesn’t like tibbles?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

    AlexsLemonade/training-modules#448 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Fix rendering of character vectors
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    AlexsLemonade/training-modules#443 · 2 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Decide on consistent terms in intro to R: environment/workspace
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#413 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add exercise notebook dev to contributing
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    contributing

    Dificultad 1/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

    AlexsLemonade/training-modules#396 · 1 reacción ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add option in `make-live.R` to only render
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

    AlexsLemonade/training-modules#389 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Set width parameter for consistent rendering
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#370 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Run two gastric samples for bulk RNA-seq
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    AlexsLemonade/training-modules#368 · 3 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • GHA: Submit a PR with rendered and live versions of notebook upon merge to master
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    automate all the things

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    AlexsLemonade/training-modules#359 · 3 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Contributing guidelines for adding input files to /shared
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    contributing

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#357 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • CONTRIBUTING: Guidelines for numbering and naming notebooks
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    contributing

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

    AlexsLemonade/training-modules#352 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Update directory layout in scRNA-seq modules
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 42/100

    AlexsLemonade/training-modules#341 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Revisit setting repos in `.Rprofile` once we have more information about server installation
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    AlexsLemonade/training-modules#308 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • [Idea] What's a gene identifier anyway? Add resources for people with this question
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#288 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • What is dimension reduction anyway?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

    AlexsLemonade/training-modules#286 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • include doublet detection in scRNA-seq
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#285 · 1 reacción ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Update tag-based workflow diagrams to include tximport
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 Medio día Aptitud para principiantes 45/100

    AlexsLemonade/training-modules#284 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Talk about scRNA-seq memory usage and rm()
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

    AlexsLemonade/training-modules#250 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Discussion: Directory structure for modules on server
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    discussion

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    AlexsLemonade/training-modules#246 · 5 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Suggestion from participant: Show directory structure more
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#239 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Link `refinebio-examples/batch-effects` to RNA-seq module
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

    AlexsLemonade/training-modules#129 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Include more analogies
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    AlexsLemonade/training-modules#122 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • two-gene scatterplot
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#107 · 5 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • scRNA-seq-advanced: investigate changes for harmony 2
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    AlexsLemonade/training-modules#1095 · 2 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

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