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wikipathways
15 indexierte Repositories · Auf GitHub ansehen
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wikipathways-database
WikiPathways Database
Shell · 19 Sterne
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wikipathways.github.io
GitHub pages for GPML-Repo
HTML · 12 Sterne
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GPML2RDF
GPML2RDF converter
Java · 4 Sterne
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SPARQLQueries
Queries for the WikiPathways SPARQL endpoint.
Python · 2 Sterne
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academy
Organized training examples for new WikiPathways authors
JavaScript · 2 Sterne
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SARS-CoV-2-WikiPathways
Temporary repository of RDF of selected pathways from WikiPathways, supporting the Wikidata bot.
Java · 2 Sterne
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WpVocabularies
WikiPathways vocabularies for RDF representation
Groovy · 1 Stern
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sandbox-wp-db
Playground for new GPML processing and curation
Shell · 1 Stern
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WikiPathwaysCurator
Unit tests that validate the WikiPathways content and support the curation of the knowledge base.
Java · 1 Stern
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wikipathways-data-release
Monthly data release
HTML · 1 Stern
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wikipathways-news
Source material for the WikiPathways News
TeX · 0 Sterne
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pfocr-database
Jekyll setup and database for the Pathway Figure OCR project
HTML · 0 Sterne
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Python · 0 Sterne
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fdp
Repository with the content of the WikiPathways FAIR Data Point.
HTML · 0 Sterne
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Java · 0 Sterne
Issues, an denen vielleicht schon jemand arbeitet, stehen am Ende. Alles nach Datum anzeigen
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Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 82/100
wikipathways/GPML2RDF#126 ·
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Editorial Vol 1 / Iss 1Evtl. wieder frei @mkutmon hat das vor 34 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
wikipathways/wikipathways-news#6 · 2 zugewiesene Personen ·
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"on pull request" not robust enoughEvtl. wieder frei @marvinm2 hat das vor 57 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenbug
wikipathways/wikipathways-database#117 · 2 zugewiesene Personen ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100
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finalize the colophonOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
wikipathways/wikipathways-news#4 · 1 Kommentar ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
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enhancement
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 48/100
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enhancement
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
wikipathways/wikipathways.github.io#158 · 1 Kommentar ·
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Add link to database location for each pathwayEvtl. wieder frei @egonw hat das vor 132 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenenhancement question
wikipathways/wikipathways.github.io#154 · 4 Kommentare · 1 Reaktion · 1 zugewiesene Person ·
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Dynamic filters suggestionsEvtl. wieder frei @marvinm2 hat das vor 221 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
wikipathways/SPARQLQueries#28 · 1 zugewiesene Person ·
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Update info on post-translational modification modellingEvtl. wieder frei @DeniseSl22 hat das vor 250 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
wikipathways/academy#57 · 1 zugewiesene Person ·
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Load FOAF ontologyEvtl. wieder frei @marvinm2 hat das vor 66 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
wikipathways/GPML2RDF#123 · 2 Kommentare · 2 zugewiesene Personen ·
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IRIs are http:// and not http://Evtl. wieder frei @marvinm2 hat das vor 270 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
wikipathways/wikipathways-iri-resolver#10 · 1 zugewiesene Person ·
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Add RDF portal information to landing pageEvtl. wieder frei @marvinm2 hat das vor 270 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
wikipathways/wikipathways-iri-resolver#9 · 1 zugewiesene Person ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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Complex IRI resolutionOffen
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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Group IRI resolutionOffen
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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DataNode IRI resolutionOffen
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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User IRI resolutionOffen
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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Pathway IRI resolutionOffen
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Generate ttl file of SPARQL queriesEvtl. wieder frei @marvinm2 hat das vor 271 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenenhancement
wikipathways/SPARQLQueries#26 · 1 zugewiesene Person ·
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GH action to verify all queriesEvtl. wieder frei @marvinm2 hat das vor 271 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
wikipathways/SPARQLQueries#25 · 1 zugewiesene Person ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
wikipathways/GPML2RDF#122 ·
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Disease ontology term not converted correctly from gpml to mdEvtl. wieder frei @egonw hat das vor 268 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenbug
wikipathways/wikipathways-database#70 · 1 Kommentar · 1 zugewiesene Person ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 57/100
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documentation
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 35/100
wikipathways/wikipathways.github.io#146 · 1 Kommentar ·
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planned
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 52/100
wikipathways/academy#53 ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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Suggested updates to WikiPathways path (purple) after WP classic is turned offEvtl. wieder frei @DeniseSl22 hat das vor 90 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenenhancement planned
wikipathways/academy#52 · 3 Kommentare · 1 zugewiesene Person ·
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Include biodirectional interactions in WP RDFEvtl. wieder frei @egonw hat das vor 467 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenenhancement
wikipathways/GPML2RDF#121 · 1 zugewiesene Person ·
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Add instructions on how to enable curation tools for user pages and community pagesEvtl. wieder frei @khanspers hat das vor 467 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenenhancement planned
wikipathways/academy#51 · 1 zugewiesene Person ·
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Handling of deleted duplicate pathwaysEvtl. wieder frei @AlexanderPico hat das vor 515 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenenhancement
wikipathways/wikipathways.github.io#142 · 1 zugewiesene Person ·
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Test for errors in `rdf:type` annotationsEvtl. wieder frei @egonw hat das vor 565 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
wikipathways/GPML2RDF#120 · 1 Kommentar · 1 zugewiesene Person ·
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Report for "at least one reference" reports pathways with non-PMC referencesEvtl. wieder frei @egonw hat das vor 664 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
wikipathways/wikipathways-collection#5 · 1 Kommentar · 1 zugewiesene Person ·
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Not all interaction are created, e.g. not for things annotated with disease (or so it seems)Evtl. wieder frei @egonw hat das vor 676 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenbug enhancement
wikipathways/GPML2RDF#119 · 1 zugewiesene Person ·
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bug
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100
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bug
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
wikipathways/pfocr-database#16 · 1 Kommentar ·
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add mastodon to footerOffenenhancement
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 45/100
wikipathways/pfocr-database#13 · 1 Kommentar ·
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enhancement
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100
wikipathways/sandbox-wp-db#27 · 1 Reaktion ·
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implement metadata for SPARQL queriesEvtl. wieder frei @egonw hat das vor 758 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenenhancement
wikipathways/SPARQLQueries#23 · 3 Kommentare · 1 Reaktion · 1 zugewiesene Person ·
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question
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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delete actionOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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License info is missingOffen
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 20/100
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