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wikipathways
15 dépôts indexés · Voir sur GitHub
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wikipathways-database
WikiPathways Database
Shell · 19 étoiles
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wikipathways.github.io
GitHub pages for GPML-Repo
HTML · 12 étoiles
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GPML2RDF
GPML2RDF converter
Java · 4 étoiles
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SPARQLQueries
Queries for the WikiPathways SPARQL endpoint.
Python · 2 étoiles
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academy
Organized training examples for new WikiPathways authors
JavaScript · 2 étoiles
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SARS-CoV-2-WikiPathways
Temporary repository of RDF of selected pathways from WikiPathways, supporting the Wikidata bot.
Java · 2 étoiles
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WpVocabularies
WikiPathways vocabularies for RDF representation
Groovy · 1 étoile
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sandbox-wp-db
Playground for new GPML processing and curation
Shell · 1 étoile
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WikiPathwaysCurator
Unit tests that validate the WikiPathways content and support the curation of the knowledge base.
Java · 1 étoile
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wikipathways-data-release
Monthly data release
HTML · 1 étoile
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wikipathways-news
Source material for the WikiPathways News
TeX · 0 étoiles
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pfocr-database
Jekyll setup and database for the Pathway Figure OCR project
HTML · 0 étoiles
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Python · 0 étoiles
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fdp
Repository with the content of the WikiPathways FAIR Data Point.
HTML · 0 étoiles
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Java · 0 étoiles
Les issues sur lesquelles quelqu’un travaille peut-être déjà sont listées en dernier. Tout trier par date
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Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 82/100
wikipathways/GPML2RDF#126 ·
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Editorial Vol 1 / Iss 1Peut-être à nouveau libre @mkutmon l’a pris il y a 28 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte
wikipathways/wikipathways-news#6 · 2 personnes assignées ·
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"on pull request" not robust enoughPeut-être à nouveau libre @marvinm2 l’a pris il y a 51 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouvertebug
wikipathways/wikipathways-database#117 · 2 personnes assignées ·
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define an editorial boardOuverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100
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finalize the colophonOuverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
wikipathways/wikipathways-news#4 · 1 commentaire ·
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
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enhancement
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 48/100
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Author order in pathway modelOuverteenhancement
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
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Add link to database location for each pathwayPeut-être à nouveau libre @egonw l’a pris il y a 126 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverteenhancement question
wikipathways/wikipathways.github.io#154 · 4 commentaires · 1 réaction · 1 personne assignée ·
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Dynamic filters suggestionsPeut-être à nouveau libre @marvinm2 l’a pris il y a 216 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte
wikipathways/SPARQLQueries#28 · 1 personne assignée ·
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Update info on post-translational modification modellingPeut-être à nouveau libre @DeniseSl22 l’a pris il y a 244 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte
wikipathways/academy#57 · 1 personne assignée ·
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Load FOAF ontologyPeut-être à nouveau libre @marvinm2 l’a pris il y a 60 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte
wikipathways/GPML2RDF#123 · 2 commentaires · 2 personnes assignées ·
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IRIs are http:// and not http://Peut-être à nouveau libre @marvinm2 l’a pris il y a 264 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte
wikipathways/wikipathways-iri-resolver#10 · 1 personne assignée ·
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Add RDF portal information to landing pagePeut-être à nouveau libre @marvinm2 l’a pris il y a 264 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte
wikipathways/wikipathways-iri-resolver#9 · 1 personne assignée ·
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Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
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Complex IRI resolutionOuverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
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PublicationXref IRI resolutionOuverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
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Group IRI resolutionOuverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
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Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
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DataNode IRI resolutionOuverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
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User IRI resolutionOuverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
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Pathway IRI resolutionOuverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
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Generate ttl file of SPARQL queriesPeut-être à nouveau libre @marvinm2 l’a pris il y a 265 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverteenhancement
wikipathways/SPARQLQueries#26 · 1 personne assignée ·
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GH action to verify all queriesPeut-être à nouveau libre @marvinm2 l’a pris il y a 265 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte
wikipathways/SPARQLQueries#25 · 1 personne assignée ·
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interaction not recognizedOuverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
wikipathways/GPML2RDF#122 ·
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Disease ontology term not converted correctly from gpml to mdPeut-être à nouveau libre @egonw l’a pris il y a 262 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouvertebug
wikipathways/wikipathways-database#70 · 1 commentaire · 1 personne assignée ·
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Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 57/100
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documentation
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 35/100
wikipathways/wikipathways.github.io#146 · 1 commentaire ·
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planned
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 52/100
wikipathways/academy#53 ·
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Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
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Suggested updates to WikiPathways path (purple) after WP classic is turned offPeut-être à nouveau libre @DeniseSl22 l’a pris il y a 84 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverteenhancement planned
wikipathways/academy#52 · 3 commentaires · 1 personne assignée ·
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
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Include biodirectional interactions in WP RDFPeut-être à nouveau libre @egonw l’a pris il y a 461 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverteenhancement
wikipathways/GPML2RDF#121 · 1 personne assignée ·
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Add instructions on how to enable curation tools for user pages and community pagesPeut-être à nouveau libre @khanspers l’a pris il y a 461 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverteenhancement planned
wikipathways/academy#51 · 1 personne assignée ·
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Handling of deleted duplicate pathwaysPeut-être à nouveau libre @AlexanderPico l’a pris il y a 509 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverteenhancement
wikipathways/wikipathways.github.io#142 · 1 personne assignée ·
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Test for errors in `rdf:type` annotationsPeut-être à nouveau libre @egonw l’a pris il y a 560 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte
wikipathways/GPML2RDF#120 · 1 commentaire · 1 personne assignée ·
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Add monthly data release stats/info on front pagePeut-être à nouveau libre @khanspers l’a pris il y a 642 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverteenhancement
wikipathways/wikipathways.github.io#126 · 2 commentaires · 1 personne assignée ·
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Report for "at least one reference" reports pathways with non-PMC referencesPeut-être à nouveau libre @egonw l’a pris il y a 658 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte
wikipathways/wikipathways-collection#5 · 1 commentaire · 1 personne assignée ·
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Not all interaction are created, e.g. not for things annotated with disease (or so it seems)Peut-être à nouveau libre @egonw l’a pris il y a 670 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouvertebug enhancement
wikipathways/GPML2RDF#119 · 1 personne assignée ·
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bug
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100
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Problems with Chemical mentionsOuverte
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100
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bug
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
wikipathways/pfocr-database#16 · 1 commentaire ·
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add mastodon to footerOuverteenhancement
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100
wikipathways/pfocr-database#13 · 1 commentaire ·
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enhancement
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100
wikipathways/sandbox-wp-db#27 · 1 réaction ·
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implement metadata for SPARQL queriesPeut-être à nouveau libre @egonw l’a pris il y a 752 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverteenhancement
wikipathways/SPARQLQueries#23 · 3 commentaires · 1 réaction · 1 personne assignée ·
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question
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
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delete actionOuverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
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Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
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License info is missingOuverte
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100
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