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py3Dmol widgets not working

Offen
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Bewertung

Schwierigkeit
4/5
Geschätzter Aufwand
3-5 Tage
Anfängerfreundlichkeit
25/100
Issue-Typ
Bug
Klarheit
Muss geklärt werden
Aktivitätsstatus
Veraltet
Tech-Stack
jupyter, jupyter-notebook, python
Bereich
documentation

Rechercherichtung

Beginne damit, das Notebook creating_networks_from_external_files in einer frischen Installation auszuführen, und reproduziere den Fehler am Einstiegspunkt interact(display_edge, index=widgets.IntSlider(...)). Untersuche das Widget- und py3Dmol-Setup des Notebooks und überprüfe anschließend, dass der Kanten-Slider das erwartete Widget ohne Fehler anzeigt.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

On a fresh install I get the below in the creating_networks_from_external_files notebook

# traverse through all views

edges = list(ligand_network.edges)

interact(display_edge, index=widgets.IntSlider(min=0, max=len(edges)-1, step=1))
>>> Error displaying widget

<function __main__.display_edge(index)>
Vorherrschende Sprache
Jupyter Notebook
Sterne
70
Forks
15
Ø Merge
4 T. 2 Std.
Gemergte PRs (30 T.)
6

Entwicklungsumgebung

Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.

Erste Schritte

  1. Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
  4. Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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