Export formats

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Bewertung

Schwierigkeit
4/5
Geschätzter Aufwand
3-5 Tage
Anfängerfreundlichkeit
35/100
Issue-Typ
Feature
Klarheit
Größtenteils klar
Aktivitätsstatus
Veraltet
Tech-Stack
sql, sqlite
Bereich
build-system, databases

Rechercherichtung

Beginne mit src/semsql/builder/build.Makefile, insbesondere mit dem main target um Zeile 51, und verfolge, wie rdftab, die relation-graph TSV, prefixes und sql_schema/semsql.sql in den SQLite-Build einfließen. Definiere, wie der Build-Befehl die Ausgabe als DSV oder SQLite auswählt, und überprüfe anschließend, dass die DSV-Ausgabe das Laden von SQLite überspringt, während der bestehende Datenbank-Build intakt bleibt.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

As part of KBase's work with ontologies in semsql, it would be very handy to be able to export as DSV directly, rather than going via the sqlite database.

We could put together a file similar to build.Makefile to perform the conversions, but I am wary of changes being made in the semsql sqlite build process that we'd have to ensure that we kept up with. I was therefore wondering about adapting the current build command to export either DSV or sqlite, depending on what args it is given.

build.Makefile line 51 onwards:

# -- MAIN TARGET --
# A db is constructed from
# (1) triples loaded using rdftab
# (2) A relation-graph TSV
%.db: %.owl %-$(RGSUFFIX).tsv $(PREFIX_CSV_PATH)
	rm -f [email protected] && \
	cat $(THIS_DIR)/sql_schema/semsql.sql | sqlite3 [email protected] && \
	echo .exit | sqlite3 -echo [email protected] -cmd ".mode csv" -cmd ".import $(PREFIX_CSV_PATH) prefix" && \
	rdftab [email protected] < $< && \
	sqlite3 [email protected] -cmd '.separator "\t"' ".import $*-$(RGSUFFIX).tsv entailed_edge" && \
	gzip -f $*-$(RGSUFFIX).tsv && \
	cat $(THIS_DIR)/indexes/*.sql | sqlite3 [email protected] && \
	echo "ALTER TABLE statements ADD COLUMN graph TEXT;" | sqlite3 [email protected] && \
	(test -d views && find views -maxdepth 1 -name '$(notdir $*)*.sql' -type f -print0 | xargs -0 -I{} sh -c 'sqlite3 [email protected]< "$$1"' sh {} || echo no views ) && \
	mv [email protected] $@
.PRECIOUS: %.db

Alter this so that if the desired output is DSV, the rdftab command is run but the sqlite db loading is omitted. Relevant files, including prefixes, relation graph, and schema SQL could be moved to a directory together or something like that.

Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
71
Forks
7
Keine gemergten PRs in 30 T.

Entwicklungsumgebung

Erste Schritte

  1. Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
  4. Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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