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Invalid --chunks/--shards arguments to b2nd-to-zarr deletes destination with --force

Offen Anfängerfreundlich
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Bewertung

Schwierigkeit
2/5
Geschätzter Aufwand
1-3 Stunden
Anfängerfreundlichkeit
68/100
Issue-Typ
Bug
Klarheit
Klar beschrieben
Aktivitätsstatus
Aktiv
Tech-Stack
python
Bereich
data

Rechercherichtung

Beginne damit, die Implementierung des Befehls b2nd-to-zarr zu lokalisieren und nachzuverfolgen, wo er das Ziel mit --force im Verhältnis zu seinem Aufruf von zarr.create_array entfernt. Reproduziere den Fehler mit den Shell-Befehlen aus dem Issue, einschließlich --chunks 30 --shards 50 --force. Als erledigt gilt die Aufgabe, wenn ungültige Argumente nicht mehr dazu führen, dass das bestehende Ziel verschwindet, wenn die Konvertierung fehlschlägt.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

Describe the bug
If a user creates a .zarr file using b2nd-to-zarr, then subsequently calls b2nd-to-zarr again with arguments to --chunks and --shards that are invalid, meaning shards % chunks != 0, then b2nd-to-zarr will call shutil.rmtree(dst_path) first and then call zarr.create_array which will fail. I think ideally the converter should throw an error before reaching zarr.create_array about invalid arguments to --chunks and --shards.

To Reproduce
Steps to reproduce the behavior:

Shell commands:

  python -c "import blosc2, numpy as np; blosc2.asarray(np.arange(1000), urlpath='data.b2nd', mode='w')"
  b2nd-to-zarr data.b2nd good.zarr -q && ls good.zarr
  b2nd-to-zarr data.b2nd good.zarr --chunks 30 --shards 50 --force

Output:

Error: Chunk edge length 50 in dimension 0 is not divisible by the shard's inner chunk size 30.

Then

  ls good.zarr

produces

ls: good.zarr: No such file or directory

Expected behavior
good.zarr should still exist even if the converter fails

Desktop:

  • OS: Mac OS Tahoe
  • Version 26.7

Additional context
I think one additional option besides throwing an earlier error message could be writing to a temporary path and then renaming it after success

Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
212
Forks
71
Ø Merge
2 T. 15 Std.
Gemergte PRs (30 T.)
12

Entwicklungsumgebung

Erste Schritte

  1. Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
  4. Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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