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Invalid --chunks/--shards arguments to b2nd-to-zarr deletes destination with --force

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Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

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Évaluation

Difficulté
2/5
Temps estimé
1-3 heures
Accessibilité débutants
68/100
Type d'issue
Bug
Clarté
Clairement spécifiée
Activité
Active
Stack technique
python
Domaine
data

Piste de recherche

Commencez par localiser l’implémentation de la commande b2nd-to-zarr et déterminer où elle supprime la destination avec --force par rapport à son appel à zarr.create_array. Reproduisez l’échec à l’aide des commandes shell de l’issue, notamment --chunks 30 --shards 50 --force. Le travail est terminé lorsque des arguments invalides ne provoquent plus la disparition de la destination existante en cas d’échec de la conversion.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

Describe the bug
If a user creates a .zarr file using b2nd-to-zarr, then subsequently calls b2nd-to-zarr again with arguments to --chunks and --shards that are invalid, meaning shards % chunks != 0, then b2nd-to-zarr will call shutil.rmtree(dst_path) first and then call zarr.create_array which will fail. I think ideally the converter should throw an error before reaching zarr.create_array about invalid arguments to --chunks and --shards.

To Reproduce
Steps to reproduce the behavior:

Shell commands:

  python -c "import blosc2, numpy as np; blosc2.asarray(np.arange(1000), urlpath='data.b2nd', mode='w')"
  b2nd-to-zarr data.b2nd good.zarr -q && ls good.zarr
  b2nd-to-zarr data.b2nd good.zarr --chunks 30 --shards 50 --force

Output:

Error: Chunk edge length 50 in dimension 0 is not divisible by the shard's inner chunk size 30.

Then

  ls good.zarr

produces

ls: good.zarr: No such file or directory

Expected behavior
good.zarr should still exist even if the converter fails

Desktop:

  • OS: Mac OS Tahoe
  • Version 26.7

Additional context
I think one additional option besides throwing an earlier error message could be writing to a temporary path and then renaming it after success

Langage dominant
Python
Étoiles
211
Forks
66
Merge moyen
2 j 1 h
PR mergées (30 j)
15

Préparer son environnement

Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

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