Owner
theislab
已索引 30 个仓库 · 在 GitHub 查看
-
single-cell-best-practices
https://www.sc-best-practices.org
Jupyter Notebook · 1267 个 star
-
scib
Benchmarking analysis of data integration tools
Python · 431 个 star
-
scarches
Reference mapping for single-cell genomics
Jupyter Notebook · 410 个 star
-
ehrapy
Electronic Health Record Analysis with Python.
Python · 361 个 star
-
HTML · 343 个 star
-
moscot
Multi-omic single-cell optimal transport tools
Python · 216 个 star
-
zellkonverter
Conversion between scRNA-seq objects
R · 210 个 star
-
CellFlow
Modeling complex perturbations with CellFlow
Python · 159 个 star
-
anndata2ri
Convert between AnnData and SingleCellExperiment
Python · 153 个 star
-
destiny
R package for single cell and other data analysis using diffusion maps
R · 113 个 star
-
DRVI
Unsupervised Deep Disentangled Representation of Single-Cell Omics
Python · 82 个 star
-
multimil
Weakly supervised learning uncovers phenotypic signatures in single-cell data
Python · 42 个 star
-
scConcept
Contrastive pre-training for technology-agnostic single-cell representations beyond reconstruction
Python · 38 个 star
-
Python · 36 个 star
-
multigrate
Multigrate: multiomic data integration for single-cell genomics
Python · 35 个 star
-
CellHermes
LoRA finetuned LLM for single cell genomics research
Python · 31 个 star
-
Python · 22 个 star
-
ReconEval
Benchmarking for gene expression from single cell latent representations
Jupyter Notebook · 21 个 star
-
cellink
Scalable framework for integrating single-cell omics with genetic data using AnnData.
Python · 21 个 star
-
Python · 17 个 star
- 还有 10 个仓库在 在 GitHub 查看
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 78/100
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 78/100
-
enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
-
theislab/zellkonverter#163 · 5 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
theislab/zellkonverter#162 · 5 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
theislab/zellkonverter#161 · 5 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 64/100
-
GSEA figure 未关闭enhancement
theislab/single-cell-best-practices#460 · 1 个 reaction · 已指派 1 人 ·
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 55/100
-
难度 5/5 一周以上 新手友好度 38/100
-
enhancement
theislab/single-cell-best-practices#458 · 3 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
bug
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 38/100
-
难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 78/100
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 58/100
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 88/100
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 58/100
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 72/100
-
难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
-
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
-
难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 35/100
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 28/100
-
enhancement
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
-
bug
难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 68/100
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 48/100
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 48/100
theislab/scConcept_rep#7 · 1 条评论 ·
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 42/100
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 62/100
theislab/zellkonverter#160 · 1 条评论 ·
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100
-
enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
theislab/single-cell-best-practices#450 · 1 条评论 · 1 个 reaction ·
-
bug
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100
-
Add scIB 未关闭enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
-
Release 未关闭
-
Fix docs build 未关闭bug
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
-
bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 45/100
-
theislab/single-cell-best-practices#447 · 13 条评论 · 已指派 2 人 ·
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 52/100
-
enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 68/100
-
enhancement good first issue
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
-
enhancement help wanted question
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 48/100
theislab/single-cell-best-practices#439 · 1 条评论 ·
-
enhancement good first issue
-
enhancement good first issue
-
enhancement good first issue
只显示最新的 100 条
这个页面只列出最近收录的部分。完整清单在高级筛选里，可以按语言、难度和预计耗时筛选。