Problem of reading dbit-seq image
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评估
调研方向
从 sd.models.Image2DModel.parse 开始，使用附件中 dbit-seq 图像的形状 (2000, 2000) 重现报告的 ValueError。确定解析器是否应接受此输入，或是否需要不同的尺寸；当目标图像可以在不出现报告的 dims 错误的情况下读取，并且已确定的行为有测试覆盖时，即视为完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Hi @LucaMarconato . Thanks for developing spatialdata-io, it is super helpful in processing spatial data. I wanted to use this package to process my dbit-seq data, but I had trouble reading the dbit-seq image with sd.models.Image2DModel.parse function. It said "ValueError: Wrong dims: ('y', 'x'). Expected ('c', 'y', 'x').". My image is (2000, 2000), and it seems that the Image2DModel doesn't work well with my data. Do you have any suggestions on this? Thanks very much!
- 主要语言
- Python
- 星标
- 107
- 派生
- 65
- 平均合并
- 10 天 10 小时
- 30 天内合并 PR
- 1
环境准备
- 没有 Dockerfile 或 Docker Compose 文件
- 没有 Pull Request 模板
- 阅读贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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