[Feature]: Equilibrium growth for equilibrium calculations
@Rick-Methot-NOAA 已经在做这个了。
开始于 2020年11月5日。
评估
这个 Issue 还没有评估数据。
描述
Imported from redmine, Issue #70928
Opened by @RickMethot on 2019-11-05
Status when imported: Under Review
benchmark calculations should be able to recalculate growth from averaged parameters rather than calculating average length from the range of years.
per Andre Punt comment at CAPAM
Code development logic below:
To achieve density-dependence, need to put biology calcs in a loop.
First stage code development steps:
create averaged MG parms
create biology-at-age from those parameters and store in styr-1 if in time_series, or styr-3 for benchmark
Second stage
put equil calcs in a loop
do the first stage calcs
loop 1 is with F=0; store store resultant equil quantities (SSB and SmryBio, etc. ) for use in density-dependent calcs
loop 2 with specified F; store resultant equil quantities; update biology-at-age
loop 3+: adjust Density-dependent parameters, including spawner-recruitment; update resultant equil quants; update biology-at-age; repeat
The calculations without density-dependence are easier because it only involves the first stage calcs.
Also, to gain some speed, the 3*Amax extra ages in equil_calcs might be made conditional such that it only occurs in the last iteration.
For styr-1, this could be invoked using this existing option:
0/1 to use steepness in initial equ recruitment calculation
- 主要语言
- C++
- 星标
- 46
- 派生
- 20
- 平均合并
- 2 天 6 小时
- 30 天内合并 PR
- 1
环境准备
在浏览器里用你自己的 GitHub 账号启动这个项目的开发容器。
- 没有 Dockerfile 或 Docker Compose 文件
- 有 Pull Request 模板
- 阅读贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
nmfs-ost/ss3-source-code 的其他 Issue
-
[Bug]: non-integer `Lbin_lo`/`Lbin_hi` are silently truncated under `Lbin_method = 1`, while method 3 raises a fatal error for the equivalent mistake可能已有人在做 @Rick-Methot-NOAA 于 17 天前认领。 未关闭
nmfs-ost/ss3-source-code#784 · 已指派 1 人 ·
-
need warning and improved logic for generalized sizecomp可能重新可做 @Rick-Methot-NOAA 于 252 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭composition in progress
nmfs-ost/ss3-source-code#751 · 1 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
[Feature]: Add standard errors for area-specific quantities可能重新可做 @Rick-Methot-NOAA 于 390 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭area & movement
nmfs-ost/ss3-source-code#731 · 3 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
[Feature]: Create a basic report list that could serve as better starting configuration for customization可能重新可做 @Rick-Methot-NOAA 于 397 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭misc. output
nmfs-ost/ss3-source-code#723 · 已指派 1 人 ·
-
[Feature]: restrict biology output using the use_morph(g) flag可能重新可做 @Rick-Methot-NOAA 于 419 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭biology misc. output ongoing
nmfs-ost/ss3-source-code#702 · 已指派 1 人 ·
查看 nmfs-ost/ss3-source-code 的全部 Issue
相似的 Issue
-
bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 66/100
维护者通常 1 天内回复
-
c++ good first issue M2: audio plumbing no hardware needed tests
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 85/100
GageLawton/noise-cancellation#23 ·
维护者通常 1 天内回复
-
Bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 72/100
维护者通常 1 天内回复
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 75/100
nullmoth/nvidia-macos-driver#126 ·
维护者通常 1 天内回复
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 78/100
objectionary/eo-graphs#85 ·