[Feature]: Equilibrium growth for equilibrium calculations
@Rick-Methot-NOAA đang làm issue này rồi.
Từ ngày 5/11/2020.
Đánh giá
Issue này chưa được đánh giá.
Mô tả
Imported from redmine, Issue #70928
Opened by @RickMethot on 2019-11-05
Status when imported: Under Review
benchmark calculations should be able to recalculate growth from averaged parameters rather than calculating average length from the range of years.
per Andre Punt comment at CAPAM
Code development logic below:
To achieve density-dependence, need to put biology calcs in a loop.
First stage code development steps:
create averaged MG parms
create biology-at-age from those parameters and store in styr-1 if in time_series, or styr-3 for benchmark
Second stage
put equil calcs in a loop
do the first stage calcs
loop 1 is with F=0; store store resultant equil quantities (SSB and SmryBio, etc. ) for use in density-dependent calcs
loop 2 with specified F; store resultant equil quantities; update biology-at-age
loop 3+: adjust Density-dependent parameters, including spawner-recruitment; update resultant equil quants; update biology-at-age; repeat
The calculations without density-dependence are easier because it only involves the first stage calcs.
Also, to gain some speed, the 3*Amax extra ages in equil_calcs might be made conditional such that it only occurs in the last iteration.
For styr-1, this could be invoked using this existing option:
0/1 to use steepness in initial equ recruitment calculation
- Ngôn ngữ chính
- C++
- Star
- 46
- Fork
- 20
- Merge trung bình
- 2 ngày 6 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 1
Chuẩn bị môi trường
Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.
- Không có Dockerfile hay tệp Docker Compose
- Có mẫu pull request
- Đọc hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của nmfs-ost/ss3-source-code
-
[Bug]: non-integer `Lbin_lo`/`Lbin_hi` are silently truncated under `Lbin_method = 1`, while method 3 raises a fatal error for the equivalent mistakeCó thể đã có người làm @Rick-Methot-NOAA đã nhận 16 ngày trước. Đang mở
nmfs-ost/ss3-source-code#784 · 1 người được giao ·
-
need warning and improved logic for generalized sizecompCó thể làm lại được @Rick-Methot-NOAA đã nhận 251 ngày trước và không có pull request nào đang mở. Đang mởcomposition in progress
nmfs-ost/ss3-source-code#751 · 1 bình luận · 1 người được giao ·
-
[Feature]: Add standard errors for area-specific quantitiesCó thể làm lại được @Rick-Methot-NOAA đã nhận 390 ngày trước và không có pull request nào đang mở. Đang mởarea & movement
nmfs-ost/ss3-source-code#731 · 3 bình luận · 1 người được giao ·
-
[Feature]: Create a basic report list that could serve as better starting configuration for customizationCó thể làm lại được @Rick-Methot-NOAA đã nhận 396 ngày trước và không có pull request nào đang mở. Đang mởmisc. output
nmfs-ost/ss3-source-code#723 · 1 người được giao ·
-
[Feature]: restrict biology output using the use_morph(g) flagCó thể làm lại được @Rick-Methot-NOAA đã nhận 418 ngày trước và không có pull request nào đang mở. Đang mởbiology misc. output ongoing
nmfs-ost/ss3-source-code#702 · 1 người được giao ·
Tất cả issue của nmfs-ost/ss3-source-code
Issue tương tự
-
bug derived types format I/O medium priority semantics
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Incorrect Link in README.mdCó thể đã có người làm Có pull request liên kết đang mở hoặc đã được merge. Đang mở
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 95/100
flameshot-org/flameshot#4996 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 64/100
utopia-rise/godot-jvm#1004 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 3 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày