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ivadomed
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ivadomed
Repository on the collaborative IVADO medical imaging project between the Mila and NeuroPoly labs.
Python · 166 个 star
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model_seg_sci
Deep-learning based segmentation of the spinal cord and intramedually lesions in traumatic and non-traumatic SCI
Python · 18 个 star
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multimodal-registration
Repository for training and using a contrast agnostic registration model based on the work done in SynthMorph. The contrast agnostic regi...
Python · 15 个 star
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ms-challenge-2021
MS segmentation challenge
Python · 13 个 star
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seg-sc-ms-lesion-multicontrast
Robust Spinal Cord MS Lesion Segmentation Across Diverse MRI Protocols and Centers
Python · 10 个 star
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utilities
Repository containing utility scripts for handling various aspects in a DL model training pipeline
Python · 9 个 star
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model-spinal-rootlets
Deep-learning based segmentation of the spinal nerve rootlets
Python · 8 个 star
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SpineReport
Automated extraction of spinal morphometrics and generation of structured radiological reports from MRI data.
Python · 8 个 star
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canproco
Code for preprocessing the CanProCo brain and spinal cord dataset
Jupyter Notebook · 5 个 star
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model-seg-dcm
Segmentation of lesions on MRI scans in patients with Degenerative Cervical Myelopathy (DCM)
Shell · 3 个 star
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model-seg-gm-wm-t2star-7t-unet2d-multiclass
A deep learning model that allows robust SC/GM multi-class segmentation based on ultra-high resolution 7T T2*-w MR images
3 个 star
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Python · 3 个 star
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model_seg_sc-gm-lesion_human_ms_exvivo_t2star
Model to segment WM, GM and MS lesions on 0.075mm isotropic GRE magnitude + phase ex vivo human samples from NIH.
Python · 3 个 star
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model_seg_csf_epi
Model repository for spinal cord csf segmentation on EPI data
Python · 2 个 star
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model_sc_centerline
Repository for automated spinal cord centerline detection using deep learning
2 个 star
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model_seg_mouse-sc_wm-gm_t1
White and grey matter segmentation on T1-weighted exvivo mouse spinal cord
Python · 2 个 star
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lumbar-classification-rsna-challenge-2024
RSNA 2024 Lumbar Spine Degenerative Classification Challenge
Python · 2 个 star
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model-seg-ms-mp2rage
Model repository for SC MS lesion segmentation on MP2RAGE-UNI data from University of Basel, National Institutes of Health (NIH) and Aix-...
Jupyter Notebook · 2 个 star
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SpineFoundation
This repo is containing all the code related to the spine foundation model.
Python · 2 个 star
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1 个 star
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可能已有人在做的 issue 排在最后。 全部按时间排序
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难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 62/100
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难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 70/100
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难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 25/100
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难度 3/5 1-2 天 新手友好度 35/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 30/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#167 · 1 条评论 ·
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100
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难度 4/5 3-5 天 新手友好度 42/100
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难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 48/100
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难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 30/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#162 · 2 条评论 ·
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难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
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VoxelMorph未关闭
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
ivadomed/model-spinal-rootlets#113 · 1 条评论 · 1 个 reaction ·
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#29 · 1 条评论 ·
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难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 45/100
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难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 90/100
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Overall Results未关闭
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 30/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-longitudinal#24 · 3 条评论 ·
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 28/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#158 · 2 条评论 ·
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100
ivadomed/model-spinal-rootlets#111 · 15 条评论 · 1 个 reaction ·
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Issue with onnx未关闭
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 42/100
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Plan to upgrade the project in order to work on 4D images ?可能重新可做 @tomDag25 于 28 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
ivadomed/model_seg_sc-gm-lesion_human_ms_exvivo_t2star#41 · 2 条评论 ·
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cervical rootlets cropped model
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 42/100
ivadomed/model-spinal-rootlets#107 · 13 条评论 ·
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难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100
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open ms results未关闭
难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#24 · 3 条评论 ·
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Ablation study未关闭
难度 5/5 一周以上 新手友好度 30/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#23 · 12 条评论 ·
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Manual segmentation of scan-rescan images可能重新可做 @plbenveniste 于 98 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#156 · 6 条评论 · 已指派 1 人 ·
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
ivadomed/model-spinal-rootlets#106 · 2 个 reaction ·
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Retrain the cervical model on cropped data可能重新可做 @AcastaPaloma 于 98 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
ivadomed/model-spinal-rootlets#105 · 已指派 1 人 ·
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难度 4/5 3-5 天 新手友好度 38/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#152 · 7 条评论 ·
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 30/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#21 · 1 条评论 ·
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-longitudinal#13 · 1 条评论 ·
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-longitudinal#12 · 1 条评论 ·
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难度 3/5 1-2 天 新手友好度 42/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-longitudinal#11 · 9 条评论 ·
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
ivadomed/model_seg_sc-gm-lesion_human_ms_exvivo_t2star#39 · 8 条评论 ·
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Add spatial regularization of motion parameters to account for slice acquisition order and B0 drift未关闭
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
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难度 3/5 1-2 天 新手友好度 55/100
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难度 5/5 一周以上 新手友好度 28/100
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难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#15 · 13 条评论 ·
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Stitching未关闭
难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
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难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#146 · 1 条评论 ·
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