Proprietario
ivadomed
42 repository indicizzati · Vedi su GitHub
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ivadomed
Repository on the collaborative IVADO medical imaging project between the Mila and NeuroPoly labs.
Python · 166 stelle
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model_seg_sci
Deep-learning based segmentation of the spinal cord and intramedually lesions in traumatic and non-traumatic SCI
Python · 18 stelle
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multimodal-registration
Repository for training and using a contrast agnostic registration model based on the work done in SynthMorph. The contrast agnostic regi...
Python · 15 stelle
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ms-challenge-2021
MS segmentation challenge
Python · 13 stelle
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seg-sc-ms-lesion-multicontrast
Robust Spinal Cord MS Lesion Segmentation Across Diverse MRI Protocols and Centers
Python · 10 stelle
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utilities
Repository containing utility scripts for handling various aspects in a DL model training pipeline
Python · 9 stelle
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model-spinal-rootlets
Deep-learning based segmentation of the spinal nerve rootlets
Python · 8 stelle
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SpineReport
Automated extraction of spinal morphometrics and generation of structured radiological reports from MRI data.
Python · 8 stelle
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canproco
Code for preprocessing the CanProCo brain and spinal cord dataset
Jupyter Notebook · 5 stelle
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model-seg-dcm
Segmentation of lesions on MRI scans in patients with Degenerative Cervical Myelopathy (DCM)
Shell · 3 stelle
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model-seg-gm-wm-t2star-7t-unet2d-multiclass
A deep learning model that allows robust SC/GM multi-class segmentation based on ultra-high resolution 7T T2*-w MR images
3 stelle
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Python · 3 stelle
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model_seg_sc-gm-lesion_human_ms_exvivo_t2star
Model to segment WM, GM and MS lesions on 0.075mm isotropic GRE magnitude + phase ex vivo human samples from NIH.
Python · 3 stelle
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model_seg_csf_epi
Model repository for spinal cord csf segmentation on EPI data
Python · 2 stelle
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model_sc_centerline
Repository for automated spinal cord centerline detection using deep learning
2 stelle
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model_seg_mouse-sc_wm-gm_t1
White and grey matter segmentation on T1-weighted exvivo mouse spinal cord
Python · 2 stelle
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lumbar-classification-rsna-challenge-2024
RSNA 2024 Lumbar Spine Degenerative Classification Challenge
Python · 2 stelle
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model-seg-ms-mp2rage
Model repository for SC MS lesion segmentation on MP2RAGE-UNI data from University of Basel, National Institutes of Health (NIH) and Aix-...
Jupyter Notebook · 2 stelle
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SpineFoundation
This repo is containing all the code related to the spine foundation model.
Python · 2 stelle
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1 stella
- 22 altri repository si trovano su Vedi su GitHub
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Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 62/100
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Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 70/100
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Code for model trainingAperta
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#167 · 1 commento ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 42/100
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 48/100
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New Model InferenceAperta
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#162 · 2 commenti ·
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Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 85/100
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Improve code documentationAperta
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
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VoxelMorphAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
ivadomed/model-spinal-rootlets#113 · 1 commento · 1 reazione ·
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Breast Cancer MRIAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#29 · 1 commento ·
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 90/100
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Overall ResultsAperta
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-longitudinal#24 · 3 commenti ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 28/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#158 · 2 commenti ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
ivadomed/model-spinal-rootlets#111 · 15 commenti · 1 reazione ·
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Issue with onnxAperta
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100
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Reproducing r20251127Aperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
ivadomed/model_seg_sc-gm-lesion_human_ms_exvivo_t2star#41 · 2 commenti ·
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cervical rootlets cropped model
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 42/100
ivadomed/model-spinal-rootlets#107 · 13 commenti ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100
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open ms resultsAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#24 · 3 commenti ·
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Ablation studyAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#23 · 12 commenti ·
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Manual segmentation of scan-rescan imagesForse di nuovo libera @plbenveniste l’ha presa 97 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#156 · 6 commenti · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
ivadomed/model-spinal-rootlets#106 · 2 reazioni ·
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Retrain the cervical model on cropped dataForse di nuovo libera @AcastaPaloma l’ha presa 97 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
ivadomed/model-spinal-rootlets#105 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-multicontrast#152 · 7 commenti ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Low data regime expAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#21 · 1 commento ·
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on-harmony resultsAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-longitudinal#13 · 1 commento ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-longitudinal#12 · 1 commento ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100
ivadomed/seg-sc-ms-lesion-longitudinal#11 · 9 commenti ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
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PAM50 registrationAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
ivadomed/model_seg_sc-gm-lesion_human_ms_exvivo_t2star#39 · 8 commenti ·
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Add spatial regularization of motion parameters to account for slice acquisition order and B0 driftAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 28/100
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MultiOrgan benchmarkAperta
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
ivadomed/palette-aug-domain-generalization#15 · 13 commenti ·
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