Update CLI to support initiate endpoint, submission ID and assay comments

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评估

难度
4/5
预计耗时
3-5 天
新手友好度
48/100
Issue 类型
功能
描述清晰度
基本清楚
活跃度
活跃
技术栈
json, python
领域
backend, cli

调研方向

Read the updated repository spec in MARS pull request #172 and inspect the CLI’s repository submission flow. Trace how it calls initiate and submit, then check how assay comments are represented in ISA-JSON. Implement the listed response handling and verify it against the integration tests; the issue says passing them requires MARS#173.

由索引模型根据 Issue 内容生成。

描述

Based on updated repository spec, update the MARS CLI:

  • For each repository, query the initiate endpoint to get submission ID and FTP credentials
  • If provided by initiate, add submission ID as a comment at the assay level, named <repo_id>_submission_id
  • If provided by initiate or submit responses, add assay comments from the repository to the ISA-JSON
  • (optional) Can use new status field in receipt to determine success/failure/pending

Passing integration tests will require elixir-europe/MARS#173

主要语言
Python
星标
1
派生
3
平均合并
1 天 7 小时
30 天内合并 PR
10

环境准备

这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南,环境需要你自己搭建:先看它的 README,通用步骤见我们的新手贡献指南。

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  1. 先读完整个 Issue,再读项目的贡献指南。
  2. 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
  3. Fork 仓库,在一个分支上完成修改。
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