Update CLI to support initiate endpoint, submission ID and assay comments
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 48/100
Direzione di ricerca
Read the updated repository spec in MARS pull request #172 and inspect the CLI’s repository submission flow. Trace how it calls initiate and submit, then check how assay comments are represented in ISA-JSON. Implement the listed response handling and verify it against the integration tests; the issue says passing them requires MARS#173.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Based on updated repository spec, update the MARS CLI:
- For each repository, query the initiate endpoint to get submission ID and FTP credentials
- If provided by initiate, add submission ID as a comment at the assay level, named
<repo_id>_submission_id - If provided by initiate or submit responses, add assay comments from the repository to the ISA-JSON
- (optional) Can use new
statusfield in receipt to determine success/failure/pending
Passing integration tests will require elixir-europe/MARS#173
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 1
- Fork
- 3
- Merge medio
- 1g 7h
- PR unite (30g)
- 10
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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