OverflowError: Python integer 256 out of bounds for uint8
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- #505 来自 @cbrnr —— 已关闭，未合并
评估
调研方向
从 wfdb/io/annotation.py 中的 proc_core_fields 开始，使用 traceback 和报告中的 demo4.py 调用来复现 OverflowError。将单独脚本中的 rdann 结果与 notebook 的行为进行比较；当 demo4.py 能够在示例数据上成功运行且不发生 uint8 溢出时，即表示完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
I am breaking the demos in the notebook in individual scripts to get acquainted with the package to learn how it works and adapt it to my needs.
Running demo4 as a separate script with python I get this error traceback:
D:\Users\xxx\Work\__WFDB\wfdb-python>python demo4.py
Traceback (most recent call last):
File "D:\Users\xxx\Work\__WFDB\wfdb-python\demo4.py", line 12, in <module>
annotation = wfdb.rdann('sample-data/100', 'atr', sampfrom=100000, sampto=110000)
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
File "D:\Users\xxx\Work\__WFDB\wfdb-python\wfdb\io\annotation.py", line 1953, in rdann
(sample, label_store, subtype, chan, num, aux_note) = proc_ann_bytes(
^^^^^^^^^^^^^^^
File "D:\Users\xxx\Work\__WFDB\wfdb-python\wfdb\io\annotation.py", line 2154, in proc_ann_bytes
sample_diff, current_label_store, bpi = proc_core_fields(filebytes, bpi)
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
File "D:\Users\xxx\Work\__WFDB\wfdb-python\wfdb\io\annotation.py", line 2240, in proc_core_fields
sample_diff += int(filebytes[bpi, 0] + 256 * (filebytes[bpi, 1] & 3))
~~~~^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
OverflowError: Python integer 256 out of bounds for uint8
The same happens with Linux (Ubuntu 22.04).
After changing the highlighted line it works like the notebook.
$ git diff
diff --git a/wfdb/io/annotation.py b/wfdb/io/annotation.py
index b398fa0..4d451b1 100644
--- a/wfdb/io/annotation.py
+++ b/wfdb/io/annotation.py
@@ -2237,7 +2237,7 @@ def proc_core_fields(filebytes, bpi):
# Not a skip - it is the actual sample number + annotation type store value
label_store = filebytes[bpi, 1] >> 2
- sample_diff += int(filebytes[bpi, 0] + 256 * (filebytes[bpi, 1] & 3))
+ sample_diff += int(filebytes[bpi, 0]) + 256 * int(filebytes[bpi, 1] & 3)
bpi = bpi + 1
return sample_diff, label_store, bpi
EDIT:
Python versions
Windows: 3.12.4
Linux: 3.10.12
- 主要语言
- Jupyter Notebook
- 星标
- 853
- 派生
- 323
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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