Ball and Stick: 171 ms per frame for a 5184-atom water box (CPK: 20 ms)
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评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 48/100
- Issue 类型
- 缺陷
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 活跃
- 技术栈
- c
- 领域
- performance
调研方向
Start with the tools/viewer-bench benchmark and profile its water-box Ball and Stick case using perf record; the issue notes that Xvfb is sufficient. Compare where CPU time is spent in moiv/viz versus the rasteriser, using the CPK case as a reference. Done when the profile identifies the repeated per-frame cost behind the 171 ms rendering time.
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Measured with tools/viewer-bench (branch wip/viewer-bench) on an NVIDIA RTX 3050, 800×800, mean ms per frame:
| System | Ball and Stick | CPK |
|---|---|---|
| water, benzene, Cr(CO)6 | 0.5–0.8 | 0.4–0.5 |
| benzene + MO isosurface | 1.0 | – |
| water box, 5184 atoms | 171 | 20 |
Render caching AUTO vs OFF makes no difference in any case.
The same atoms draw 8.5× faster in CPK, so the cost is in the bond path of Ball and Stick. A few thousand cylinders in immediate-mode GL take a few ms on this GPU; 170 ms suggests CPU work repeated every frame (bond finding or geometry rebuilt per render) rather than GL submission. Rewriting moiv's drawing to vertex buffers would therefore probably not address it.
Next step: a CPU profile (perf record) of the benchmark's water-box Ball and Stick case; Xvfb is sufficient, as the profile separates moiv/viz time from the rasteriser. Relevant only for large systems (MD boxes, proteins); teaching-sized molecules render in under 1 ms.
- 主要语言
- C
- 星标
- 10
- 派生
- 8
- 平均合并
- 21 分钟
- 30 天内合并 PR
- 1
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
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