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Ball and Stick: 171 ms per frame for a 5184-atom water box (CPK: 20 ms)

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Évaluation

Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Accessibilité débutants
48/100
Type d'issue
Bug
Clarté
Plutôt claire
Activité
Active
Stack technique
c
Domaine
performance

Piste de recherche

Start with the tools/viewer-bench benchmark and profile its water-box Ball and Stick case using perf record; the issue notes that Xvfb is sufficient. Compare where CPU time is spent in moiv/viz versus the rasteriser, using the CPK case as a reference. Done when the profile identifies the repeated per-frame cost behind the 171 ms rendering time.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

Measured with tools/viewer-bench (branch wip/viewer-bench) on an NVIDIA RTX 3050, 800×800, mean ms per frame:

System Ball and Stick CPK
water, benzene, Cr(CO)6 0.5–0.8 0.4–0.5
benzene + MO isosurface 1.0 –
water box, 5184 atoms 171 20

Render caching AUTO vs OFF makes no difference in any case.

The same atoms draw 8.5× faster in CPK, so the cost is in the bond path of Ball and Stick. A few thousand cylinders in immediate-mode GL take a few ms on this GPU; 170 ms suggests CPU work repeated every frame (bond finding or geometry rebuilt per render) rather than GL submission. Rewriting moiv's drawing to vertex buffers would therefore probably not address it.

Next step: a CPU profile (perf record) of the benchmark's water-box Ball and Stick case; Xvfb is sufficient, as the profile separates moiv/viz time from the rasteriser. Relevant only for large systems (MD boxes, proteins); teaching-sized molecules render in under 1 ms.

Langage dominant
C
Étoiles
10
Forks
8
Merge moyen
21 min
PR mergées (30 j)
1

Préparer son environnement

Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.

Par où commencer

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