AllenInstitute/AllenSDK

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• Nightly workflow fails before tests when checkout ref uses rc/**

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  难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 72/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2785 · 2026年9月21日 创建

• [Bug]: multipletests import fails in receptive_field.py

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  难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 92/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2783 · 2026年9月14日 创建

• [Bug]: Allensdk running on paper space is stuck in an infinite loading loop for sessions

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  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2782 · 2 条评论 · 2026年8月28日 创建

• Visual coding dataset channels.y==channels.z in persession nwb file?

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  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2776 · 2026年3月13日 创建

• on-prem test is out of date and cannot pass

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  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2773 · 2026年2月17日 创建

• Tro

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  难度 5/5 一周以上 新手友好度 5/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2766 · 2025年11月27日 创建

• Spike waveform templates in the allensdk?

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  难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2763 · 2025年11月19日 创建

• Update on feature updates

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  难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2761 · 3 条评论 · 4 个 reaction · 2025年6月12日 创建

• Spinal Cord ccf

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  难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2760 · 2025年5月16日 创建

• documentation format availability?

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  难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2759 · 2025年5月15日 创建

• map from natural scene template ID to stimulus condition ID for brain observatory datasets?

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 35/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2758 · 2025年4月6日 创建

• Assistance with Accessing Expression Grid Data via Allen Brain Atlas API

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  难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2755 · 2025年3月14日 创建

• Some metadata csv files don't get downloaded from `EcephysProjectCachce.from_warehouse`

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2753 · 6 条评论 · 2024年12月13日 创建

• Add progress bar when loading data

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  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 38/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2752 · 2024年11月24日 创建

• Missing links to model example .tgz files

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  难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 52/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2749 · 2024年9月9日 创建

• automatic retrival of connections data

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  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 25/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2748 · 2024年9月9日 创建

• incorrect values for `imaging_depth` column in VisualBehaviorOphysProjectCache ophys_experiment_table

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  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2745 · 2 条评论 · 2024年8月3日 创建

• Retrieving Shuffled Frame IDs

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  难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2743 · 2024年4月7日 创建

• Unable to download cache files

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 35/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2742 · 2024年1月16日 创建

• Creating drifting gratings (frame by frame)

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 25/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2739 · 2023年12月27日 创建

• Broken .get_performance_metrics() method in VisualBehaviorNeuropixelsProjectCache.from_s3_cache(cache_dir=neuropixel_dataset_behavior)

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2733 · 2 条评论 · 2023年11月9日 创建

• Update conda-forge package

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 38/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2727 · 2 条评论 · 2023年10月7日 创建

• DriftingGratings.get_response() does not explain what the ncells+1'th response corresponds to

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  AllenInstitute/AllenSDK#2719 · 2023年8月29日 创建

• incorrect task parameter value in session metadata for TRAINING_0 and TRAINING_1

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  AllenInstitute/AllenSDK#2717 · 1 条评论 · 2023年8月19日 创建

• Simultaneously importing `ecephys_project_cache` and `behavior_ecephys_session` breaks nwb file reading

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  AllenInstitute/AllenSDK#2713 · 3 条评论 · 2023年8月9日 创建

• KeyError: 'sweeps_by_type'

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  AllenInstitute/AllenSDK#2711 · 2023年8月4日 创建

• How to access Neuropixels session end time?

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 25/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2709 · 2023年7月27日 创建

• Issue with statsmodels in allensdk install

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 30/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2705 · 1 条评论 · 2023年7月23日 创建

• how can I get the brain surface dorsal-ventral ccf coordinates for different probes?

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  AllenInstitute/AllenSDK#2702 · 2023年7月19日 创建

• Add 'quality' column to VBN units metadata table

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  AllenInstitute/AllenSDK#2696 · 1 条评论 · 2023年7月12日 创建

• Request (Allen Brain Observatory Data): Access to ophys metadata as csv files

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  AllenInstitute/AllenSDK#2694 · 2023年7月2日 创建

• Error reading NWB file while session cache is instantiated in workspace

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  AllenInstitute/AllenSDK#2693 · 2023年6月26日 创建

• JSONDecodeError when running oapi.get_structures_with_sets([1])

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  AllenInstitute/AllenSDK#2684 · 1 条评论 · 2023年5月25日 创建

• Ophys NWB Conversion fails if a dff file is missing

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  AllenInstitute/AllenSDK#2683 · 9 条评论 · 2023年5月9日 创建

• add_lfp_to_nwb Function seems to add the LFP probe data twice

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  AllenInstitute/AllenSDK#2681 · 2023年4月26日 创建

• Optogenetic information in NWB files could be using a more specific data type

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  AllenInstitute/AllenSDK#2680 · 2023年4月26日 创建

• datasets diffrences

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  AllenInstitute/AllenSDK#2677 · 1 条评论 · 2023年4月13日 创建

• extract event trace

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  AllenInstitute/AllenSDK#2676 · 2023年4月13日 创建

• Using imread for Ophys Projections automatically casts them to floats

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  AllenInstitute/AllenSDK#2672 · 2023年3月31日 创建

• Flipped running polarity for VBN behavior only sessions

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  AllenInstitute/AllenSDK#2661 · 13 条评论 · 2023年2月16日 创建

• Backward compatibility between allensdk 2.13.5 and 2.14.1 broken for VBN manifest 0.3.0

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  AllenInstitute/AllenSDK#2646 · 2023年1月18日 创建

• Add is_sham_change to VBN stimulus_presentations table

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  AllenInstitute/AllenSDK#2643 · 2 条评论 · 2023年1月12日 创建

• Notebooks should use seeds

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  enhancement notebook

  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2636 · 2022年12月14日 创建

• Inconsistent datasets from `EcephysSession.presentationwise_spike_times method`

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  AllenInstitute/AllenSDK#2634 · 1 条评论 · 2022年12月13日 创建

• Revert optional traces logic once VBO updated data released

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  AllenInstitute/AllenSDK#2632 · 1 条评论 · 2022年12月12日 创建

• Progress bar for Visual Coding Neuropixel csv files downloading

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  AllenInstitute/AllenSDK#2631 · 2022年12月10日 创建

• Unskip tests

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  AllenInstitute/AllenSDK#2628 · 2022年12月8日 创建

• Move eyetracking into a github repo

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  难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100

  AllenInstitute/AllenSDK#2621 · 1 条评论 · 2022年11月30日 创建

• Package add on Eye Tracking data for Saskia.

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  AllenInstitute/AllenSDK#2608 · 2 条评论 · 2022年11月15日 创建

• Remove `from_json` functionality.

  可能重新可做 @mikejhuang 于 1415 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  AllenInstitute/AllenSDK#2607 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2022年11月15日 创建