Hacktoberfest 2026:メンテナが10月に向けて印を付けた、オープンで初心者向けの issue。 Hacktoberfest の issue を見る

code for reading and processing Allen Institute for Brain Science data

AllenInstitute/AllenSDK は初心者に優しい?

AllenInstitute/AllenSDK への外部コントリビューターの PR が最近は少なく、どのくらいマージされるかはまだ言えません。 初心者向けの issue が現在 2 件オープンです。

スター
398
フォーク
164
オープンの初心者向け issue
2
索引済み issue
378
主要言語
Jupyter Notebook
ライセンス
ライセンスのデータがありません
最終 GitHub push
2026年7月6日
最新の索引
2026年9月20日
コントリビューションガイド
コントリビューションガイド
行動規範
行動規範がありません
初心者向けラベル
good first issue help wanted
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

AllenInstitute/AllenSDK にコントリビュートするには

  1. まずコントリビューションガイドを読みましょう。変更の提案、テスト、レビューの進め方が書かれています。
  2. 下にある 2 件の初心者向けのオープンな issue から 1 つ選び、作業を始める前に取り組みたいとコメントしましょう。
issue を読み込んでいます

誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示

  • Nightly workflow fails before tests when checkout ref uses rc/**
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 72/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2785 ·

  • [Bug]: multipletests import fails in receptive_field.py
    オープン
    bug

    難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 92/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2783 ·

  • [Bug]: Allensdk running on paper space is stuck in an infinite loading loop for sessions
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2782 · コメント 1 件 ·

  • Visual coding dataset channels.y==channels.z in persession nwb file?
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2776 ·

  • on-prem test is out of date and cannot pass
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2773 ·

  • Tro
    オープン
    bug

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 5/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2766 ·

  • Spike waveform templates in the allensdk?
    オープン
    question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2763 ·

  • Update on feature updates
    オープン
    question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2761 · コメント 3 件 · リアクション 4 件 ·

  • Spinal Cord ccf
    オープン
    question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2760 ·

  • documentation format availability?
    オープン
    question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2759 ·

  • map from natural scene template ID to stimulus condition ID for brain observatory datasets?
    オープン
    question

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2758 ·

  • Assistance with Accessing Expression Grid Data via Allen Brain Atlas API
    オープン
    question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2755 ·

  • Some metadata csv files don't get downloaded from `EcephysProjectCachce.from_warehouse`
    オープン
    bug

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2753 · コメント 6 件 ·

  • Add progress bar when loading data
    オープン
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2752 ·

  • Missing links to model example .tgz files
    オープン
    bug

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 52/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2749 ·

  • automatic retrival of connections data
    オープン
    question

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2748 ·

  • incorrect values for `imaging_depth` column in VisualBehaviorOphysProjectCache ophys_experiment_table
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2745 · コメント 2 件 ·

  • Retrieving Shuffled Frame IDs
    オープン
    question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2743 ·

  • Unable to download cache files
    オープン
    bug

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2742 ·

  • Creating drifting gratings (frame by frame)
    オープン
    question

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2739 ·

  • Broken .get_performance_metrics() method in VisualBehaviorNeuropixelsProjectCache.from_s3_cache(cache_dir=neuropixel_dataset_behavior)
    オープン
    bug

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2733 · コメント 2 件 ·

  • Update conda-forge package
    オープン
    enhancement

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 38/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2727 · コメント 2 件 ·

  • DriftingGratings.get_response() does not explain what the ncells+1'th response corresponds to
    オープン
    bug

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 45/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2719 ·

  • incorrect task parameter value in session metadata for TRAINING_0 and TRAINING_1
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2717 · コメント 1 件 ·

  • Simultaneously importing `ecephys_project_cache` and `behavior_ecephys_session` breaks nwb file reading
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2713 · コメント 3 件 ·

  • KeyError: 'sweeps_by_type'
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2711 ·

  • How to access Neuropixels session end time?
    オープン
    question

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2709 ·

  • Issue with statsmodels in allensdk install
    オープン
    bug

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 30/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2705 · コメント 1 件 ·

  • how can I get the brain surface dorsal-ventral ccf coordinates for different probes?
    オープン
    question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2702 ·

  • Add 'quality' column to VBN units metadata table
    オープン
    enhancement

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2696 · コメント 1 件 ·

  • Request (Allen Brain Observatory Data): Access to ophys metadata as csv files
    オープン
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2694 ·

  • Error reading NWB file while session cache is instantiated in workspace
    オープン
    question

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2693 ·

  • JSONDecodeError when running oapi.get_structures_with_sets([1])
    オープン
    bug

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2684 · コメント 1 件 ·

  • Ophys NWB Conversion fails if a dff file is missing
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2683 · コメント 9 件 ·

  • add_lfp_to_nwb Function seems to add the LFP probe data twice
    オープン
    question

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 42/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2681 ·

  • Optogenetic information in NWB files could be using a more specific data type
    オープン
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2680 ·

  • datasets diffrences
    オープン
    question

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2677 · コメント 1 件 ·

  • extract event trace
    オープン
    question

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 20/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2676 ·

  • Using imread for Ophys Projections automatically casts them to floats
    オープン
    bug

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 45/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2672 ·

  • Flipped running polarity for VBN behavior only sessions
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 32/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2661 · コメント 13 件 ·

  • Backward compatibility between allensdk 2.13.5 and 2.14.1 broken for VBN manifest 0.3.0
    オープン
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 42/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2646 ·

  • Add is_sham_change to VBN stimulus_presentations table
    オープン
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2643 · コメント 2 件 ·

  • Notebooks should use seeds
    オープン
    enhancement notebook

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2636 ·

  • Inconsistent datasets from `EcephysSession.presentationwise_spike_times method`
    オープン
    bug

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 55/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2634 · コメント 1 件 ·

  • Revert optional traces logic once VBO updated data released
    オープン
    vbo

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2632 · コメント 1 件 ·

  • Progress bar for Visual Coding Neuropixel csv files downloading
    オープン
    enhancement

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2631 ·

  • Unskip tests
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2628 ·

  • Move eyetracking into a github repo
    オープン
    Epic

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2621 · コメント 1 件 ·

  • Package add on Eye Tracking data for Saskia.
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

    AllenInstitute/AllenSDK#2608 · コメント 2 件 ·

  • Remove `from_json` functionality.
    再び着手できるかも @mikejhuang が 1412 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    AllenInstitute/AllenSDK#2607 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 ·

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