nipoppy

可能已有人在做的 issue 排在最後。 全部依時間排序

• [MAINT] Make the lockfile update only run on the `nipoppy/nipoppy` repo

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  T.2 - Maintenance

  難度 2/5 1 小時以內 新手友好度 50/100

  nipoppy/nipoppy#1231 · 2026年11月1日 建立

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• [MAINT] Build CohortBuilder

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  T.2 - Maintenance

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100

  nipoppy/nipoppy#1223 · 2026年10月22日 建立

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• [ENH] Consider adding `--no-home` Apptainer arg in default study config file

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  T.1 - Enhancement

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 58/100

  nipoppy/nipoppy#1222 · 1 個 reaction · 2026年10月21日 建立

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• [BUG] Study-level .env is not loaded when another option comes before --study

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  T.0 - Bug

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 82/100

  nipoppy/nipoppy#1221 · 2026年10月20日 建立

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• [BUG] Obscure error when pipeline variable is not defined

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  T.0 - Bug

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 66/100

  nipoppy/nipoppy#1220 · 2026年10月20日 建立

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• [BUG] Weird log output in pipeline validation

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  T.0 - Bug

  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 52/100

  nipoppy/nipoppy#1218 · 2026年10月20日 建立

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• [MAINT] Favour WorkflowError over SystemExit

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  T.2 - Maintenance

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 65/100

  nipoppy/nipoppy#1216 · 2026年10月20日 建立

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• [BUG] Project workflow: Issue not moved to done when not associated with a PR

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  T.0 - Bug

  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 35/100

  nipoppy/nipoppy#1214 · 2026年10月20日 建立

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• [ENH] Add `--debug` alias for `--verbose`

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  T.1 - Enhancement

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 80/100

  nipoppy/nipoppy#1205 · 1 則留言 · 2026年10月16日 建立

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• [ENH] Log success / total HPC job submitted

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  T.1 - Enhancement

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 62/100

  nipoppy/nipoppy#1193 · 2026年10月15日 建立

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• [MAINT] How should TelemetryHandler behaves when called before initialization ?

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  T.2 - Maintenance

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100

  nipoppy/nipoppy#1189 · 1 則留言 · 2026年10月6日 建立

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• [MAINT] Use mocker instead of monkeypatch.setattr in telemetry tests

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  T.2 - Maintenance

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 42/100

  nipoppy/nipoppy#1188 · 2026年10月6日 建立

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• [ENH] track dry run in telemetry

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  T.1 - Enhancement

  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 57/100

  nipoppy/nipoppy#1187 · 2026年10月6日 建立

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• [MAINT] Remove `metric_reader` argument from `TelemetryHandler`

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  T.2 - Maintenance

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 67/100

  nipoppy/nipoppy#1186 · 2026年10月6日 建立

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• [DOC] Add Code of conduct

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  T.3 - Documentation T.7 - Discussion

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 65/100

  nipoppy/nipoppy#1183 · 1 則留言 · 2026年10月2日 建立

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• [ENH] Track zenodo id origin of pipeline

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難度 5/5 一週以上 新手友好度 35/100

  nipoppy/nipoppy#1177 · 2026年10月1日 建立

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• [DOC] Update the pipelines/README.md file

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  T.3 - Documentation

  難度 1/5 1 小時以內 新手友好度 62/100

  nipoppy/nipoppy#1139 · 2026年9月10日 建立

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• [MAINT] User configuration for Telemetry data collection

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  T.2 - Maintenance

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 47/100

  nipoppy/nipoppy#1130 · 1 則留言 · 2026年9月8日 建立

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• [ENH] Publish schemas and add `"$schema"` field to all config files

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  T.1 - Enhancement

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 55/100

  nipoppy/nipoppy#1125 · 2026年9月2日 建立

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• [MAINT] Refactor `ContainerHandler` to separate container and containerless runtimes

  可能重新可做 @mathdugre 於 56 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉

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  T.2 - Maintenance

  nipoppy/nipoppy#1124 · 已指派 1 人 · 2026年9月2日 建立

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• [MAINT] Rework schemas for runtime (container + other) configs

  可能重新可做 @mathdugre 於 56 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉

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  P.0 - Breaking change T.2 - Maintenance

  nipoppy/nipoppy#1122 · 已指派 1 人 · 2026年9月1日 建立

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• [MAINT] Pin all dependences to be < next major version

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  T.2 - Maintenance

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100

  nipoppy/nipoppy#1119 · 2026年9月1日 建立

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• [ENH] Relax the study layout to have optional directories

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  T.1 - Enhancement

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 43/100

  nipoppy/nipoppy#1118 · 2026年8月28日 建立

  維護者通常 3 天內回覆

• [BUG] `--simulate` should not request an HPC allocation

  可能重新可做 @mathdugre 於 51 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉

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  T.0 - Bug

  nipoppy/nipoppy#1117 · 4 則留言 · 已指派 1 人 · 2026年8月27日 建立

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• [MAINT] Verify if Manifest session_id/visit_id validation is still needed/useful

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  T.2 - Maintenance

  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 55/100

  nipoppy/nipoppy#1113 · 2026年8月25日 建立

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• [MAINT] Reduce duplication of information between pipeline descriptor and config

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  T.2 - Maintenance T.7 - Discussion

  難度 5/5 一週以上 新手友好度 30/100

  nipoppy/nipoppy#1112 · 2026年8月25日 建立

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• [BUG] Support use of generic Zenodo record ID

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  T.0 - Bug

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100

  nipoppy/nipoppy#1111 · 2026年8月25日 建立

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• [DOC] Clarify Zenodo token creation

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  T.3 - Documentation

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 72/100

  nipoppy/nipoppy#1110 · 2026年8月25日 建立

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• [MAINT] Cleanup `create_bundle` function

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  T.2 - Maintenance

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 58/100

  nipoppy/nipoppy#1103 · 1 則留言 · 2026年8月19日 建立

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• [ENH] Add `"BIND_PATHS"` field to default pipeline `config.json`

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  T.1 - Enhancement

  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 42/100

  nipoppy/nipoppy#1102 · 2026年8月17日 建立

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• [BUG] Test failing on systems without Docker installed (?)

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  T.0 - Bug

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 66/100

  nipoppy/nipoppy#1098 · 2026年8月11日 建立

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• [DOC] Document `BIDS_PATH_INJECTION_MAP` in pipeline creation guide

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  T.3 - Documentation

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 70/100

  nipoppy/nipoppy#1096 · 2026年8月10日 建立

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• [ENH] Allow user-specific template HPC job submission script

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  T.1 - Enhancement

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 52/100

  nipoppy/nipoppy#1089 · 2 則留言 · 2026年8月6日 建立

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• [ENH] Flag to prevent overriding processing status file

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難度 5/5 一週以上 新手友好度 38/100

  nipoppy/nipoppy#1084 · 2026年8月3日 建立

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• [DOC] Change example pipeline in "pipeline create" guide

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  T.3 - Documentation

  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 54/100

  nipoppy/nipoppy#1078 · 2026年7月30日 建立

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• [ENH] Check for new release on Nipoppy command execution

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  T.1 - Enhancement

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100

  nipoppy/nipoppy#1076 · 1 則留言 · 2026年7月28日 建立

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• [ENH] Add HPC partition substitution to default study config file

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  T.1 - Enhancement

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 73/100

  nipoppy/nipoppy#1068 · 2026年7月23日 建立

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• [BUG] Pipeline launch fails if config file for other pipeline is invalid

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  T.0 - Bug T.7 - Discussion

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 64/100

  nipoppy/nipoppy#1061 · 2026年7月17日 建立

  維護者通常 3 天內回覆

• [ENH] Leverage the bosh descriptor `output-files` field when creating the initial `tracker.json` config

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 47/100

  nipoppy/nipoppy#1054 · 2026年7月2日 建立

  維護者通常 3 天內回覆

• [ENH] pipeline create should use the "suggested-resources" from descriptor

  未關閉

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 57/100

  nipoppy/nipoppy#1050 · 2026年6月25日 建立

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• [ENH] make the --pipeline option case insensitive

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  good first issue T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 58/100

  nipoppy/nipoppy#1049 · 1 則留言 · 2026年6月25日 建立

  維護者通常 3 天內回覆

• [BUG] Nipoppy pipeline validation fails when descriptor has a Zenodo record in the "tool-doi" field

  可能重新可做 關聯的 PR 已關閉且未合併。 未關閉

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  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 48/100

  nipoppy/nipoppy#1048 · 1 則留言 · 2026年6月25日 建立

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• [BUG] File IO operations are done with `--simulate`

  未關閉

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  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 52/100

  nipoppy/nipoppy#1042 · 2026年6月13日 建立

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• [ENH] Point to pipeline README if available

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難度 3/5 1-2 天 新手友好度 55/100

  nipoppy/nipoppy#1037 · 1 則留言 · 2026年6月8日 建立

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• [MAINT] Refactor pipeline_validation.py into a handler class

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  T.1 - Enhancement T.2 - Maintenance

  難度 4/5 1-2 天 新手友好度 45/100

  nipoppy/nipoppy#1031 · 2026年6月5日 建立

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• [MAINT] Group tests using classes

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  T.2 - Maintenance

  難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 48/100

  nipoppy/nipoppy#1028 · 1 則留言 · 2026年5月28日 建立

  維護者通常 3 天內回覆

• [MAINT] prevent emphasize-lines drift in docs sample configs

  可能重新可做 @laurapiro17 於 198 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉

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  stale T.2 - Maintenance

  nipoppy/nipoppy#990 · 4 則留言 · 已指派 1 人 · 2026年4月21日 建立

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• [MAINT] Make `DatasetLayout` explicitly part of the public API

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  stale T.2 - Maintenance

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  nipoppy/nipoppy#977 · 1 則留言 · 2026年4月9日 建立

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• [MAINT] Make `Study` explicitly part of the public API

  未關閉

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  stale T.2 - Maintenance

  難度 4/5 3-5 天 新手友好度 38/100

  nipoppy/nipoppy#976 · 1 則留言 · 2026年4月9日 建立

  維護者通常 3 天內回覆

• [MAINT] Unified CLI command for `nipoppy run`

  未關閉

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  T.2 - Maintenance T.7 - Discussion

  難度 5/5 一週以上 新手友好度 25/100

  nipoppy/nipoppy#969 · 2026年4月7日 建立

  維護者通常 3 天內回覆