nipoppy

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• [TEST] Use current date when uploading test records to Zenodo sandbox

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 72/100

  nipoppy/nipoppy#1206 · 2026年10月18日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [ENH] Add `--debug` alias for `--verbose`

  オープン

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  T.1 - Enhancement

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 80/100

  nipoppy/nipoppy#1205 · コメント 1 件 · 2026年10月16日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [ENH] Log success / total HPC job submitted

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  T.1 - Enhancement

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 62/100

  nipoppy/nipoppy#1193 · 2026年10月15日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [MAINT] How should TelemetryHandler behaves when called before initialization ?

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  T.2 - Maintenance

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

  nipoppy/nipoppy#1189 · コメント 1 件 · 2026年10月6日 に作成

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• [MAINT] Use mocker instead of monkeypatch.setattr in telemetry tests

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  T.2 - Maintenance

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 42/100

  nipoppy/nipoppy#1188 · 2026年10月6日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [ENH] track dry run in telemetry

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  T.1 - Enhancement

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 57/100

  nipoppy/nipoppy#1187 · 2026年10月6日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [MAINT] Remove `metric_reader` argument from `TelemetryHandler`

  オープン

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  T.2 - Maintenance

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 67/100

  nipoppy/nipoppy#1186 · 2026年10月6日 に作成

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• [DOC] Add Code of conduct

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  T.3 - Documentation

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 65/100

  nipoppy/nipoppy#1183 · 2026年10月2日 に作成

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• [ENH] Track zenodo id origin of pipeline

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  nipoppy/nipoppy#1177 · 2026年10月1日 に作成

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• [DOC] Weird rendering of the doc in GitHub diff

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  T.3 - Documentation

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 45/100

  nipoppy/nipoppy#1166 · 2026年9月22日 に作成

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• [MAINT] Reduce verbosity of `nipoppy status`

  オープン

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  T.2 - Maintenance

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100

  nipoppy/nipoppy#1164 · 担当者 1 名 · 2026年9月22日 に作成

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• [BUG] Nipoppy .env not used by the pipeline sub-command

  オープン

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  T.0 - Bug

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 73/100

  nipoppy/nipoppy#1155 · コメント 1 件 · 2026年9月17日 に作成

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• [DOC] Update the pipelines/README.md file

  オープン

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  T.3 - Documentation

  難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 62/100

  nipoppy/nipoppy#1139 · 2026年9月10日 に作成

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• [MAINT] User configuration for Telemetry data collection

  オープン

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  T.2 - Maintenance

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 47/100

  nipoppy/nipoppy#1130 · コメント 1 件 · 2026年9月8日 に作成

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• [ENH] Publish schemas and add `"$schema"` field to all config files

  オープン

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  T.1 - Enhancement

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 55/100

  nipoppy/nipoppy#1125 · 2026年9月2日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [MAINT] Refactor `ContainerHandler` to separate container and containerless runtimes

  再び着手できるかも @mathdugre が 39 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  T.2 - Maintenance

  nipoppy/nipoppy#1124 · 担当者 1 名 · 2026年9月2日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [MAINT] Rework schemas for runtime (container + other) configs

  再び着手できるかも @mathdugre が 39 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  P.0 - Breaking change T.2 - Maintenance

  nipoppy/nipoppy#1122 · 担当者 1 名 · 2026年9月1日 に作成

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• [MAINT] Pin all dependences to be < next major version

  オープン

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  T.2 - Maintenance

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

  nipoppy/nipoppy#1119 · 2026年9月1日 に作成

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• [ENH] Relax the study layout to have optional directories

  オープン

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  T.1 - Enhancement

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 43/100

  nipoppy/nipoppy#1118 · 2026年8月28日 に作成

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• [BUG] `--simulate` should not request an HPC allocation

  再び着手できるかも @mathdugre が 34 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  T.0 - Bug

  nipoppy/nipoppy#1117 · コメント 4 件 · 担当者 1 名 · 2026年8月27日 に作成

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• [MAINT] Verify if Manifest session_id/visit_id validation is still needed/useful

  オープン

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  T.2 - Maintenance

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

  nipoppy/nipoppy#1113 · 2026年8月25日 に作成

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• [MAINT] Reduce duplication of information between pipeline descriptor and config

  オープン

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  T.2 - Maintenance T.7 - Discussion

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100

  nipoppy/nipoppy#1112 · 2026年8月25日 に作成

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• [BUG] Support use of generic Zenodo record ID

  オープン

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  T.0 - Bug

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

  nipoppy/nipoppy#1111 · 2026年8月25日 に作成

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• [DOC] Clarify Zenodo token creation

  オープン

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  T.3 - Documentation

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 72/100

  nipoppy/nipoppy#1110 · 2026年8月25日 に作成

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• [BUG] Zenodo upload integration test does not set keyword properly

  オープン

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  T.0 - Bug

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 78/100

  nipoppy/nipoppy#1106 · 2026年8月21日 に作成

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• [MAINT] Cleanup `create_bundle` function

  オープン

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  T.2 - Maintenance

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 58/100

  nipoppy/nipoppy#1103 · コメント 1 件 · 2026年8月19日 に作成

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• [ENH] Add `"BIND_PATHS"` field to default pipeline `config.json`

  オープン

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  T.1 - Enhancement

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 42/100

  nipoppy/nipoppy#1102 · 2026年8月17日 に作成

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• [BUG] Test failing on systems without Docker installed (?)

  オープン

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  T.0 - Bug

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 66/100

  nipoppy/nipoppy#1098 · 2026年8月11日 に作成

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• [DOC] Document `BIDS_PATH_INJECTION_MAP` in pipeline creation guide

  オープン

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  T.3 - Documentation

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 70/100

  nipoppy/nipoppy#1096 · 2026年8月10日 に作成

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• [ENH] Allow user-specific template HPC job submission script

  オープン

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  T.1 - Enhancement

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 52/100

  nipoppy/nipoppy#1089 · コメント 2 件 · 2026年8月6日 に作成

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• [ENH] Flag to prevent overriding processing status file

  オープン

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 38/100

  nipoppy/nipoppy#1084 · 2026年8月3日 に作成

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• [DOC] Change example pipeline in "pipeline create" guide

  オープン

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  T.3 - Documentation

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 54/100

  nipoppy/nipoppy#1078 · 2026年7月30日 に作成

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• [ENH] Check for new release on Nipoppy command execution

  オープン

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  T.1 - Enhancement

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

  nipoppy/nipoppy#1076 · コメント 1 件 · 2026年7月28日 に作成

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• [ENH] Add HPC partition substitution to default study config file

  オープン

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  T.1 - Enhancement

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 73/100

  nipoppy/nipoppy#1068 · 2026年7月23日 に作成

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• [BUG] Pipeline launch fails if config file for other pipeline is invalid

  オープン

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  T.0 - Bug T.7 - Discussion

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 64/100

  nipoppy/nipoppy#1061 · 2026年7月17日 に作成

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• [ENH] Leverage the bosh descriptor `output-files` field when creating the initial `tracker.json` config

  オープン

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 47/100

  nipoppy/nipoppy#1054 · 2026年7月2日 に作成

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• [ENH] pipeline create should use the "suggested-resources" from descriptor

  オープン

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 57/100

  nipoppy/nipoppy#1050 · 2026年6月25日 に作成

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• [ENH] make the --pipeline option case insensitive

  オープン

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  good first issue T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 58/100

  nipoppy/nipoppy#1049 · コメント 1 件 · 2026年6月25日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [BUG] Nipoppy pipeline validation fails when descriptor has a Zenodo record in the "tool-doi" field

  再び着手できるかも このイシューのプルリクエストはマージされずにクローズされました。 オープン

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  T.0 - Bug

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

  nipoppy/nipoppy#1048 · コメント 1 件 · 2026年6月25日 に作成

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• [BUG] File IO operations are done with `--simulate`

  オープン

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  T.0 - Bug T.7 - Discussion

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 52/100

  nipoppy/nipoppy#1042 · 2026年6月13日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [ENH] Point to pipeline README if available

  オープン

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  T.1 - Enhancement T.7 - Discussion

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

  nipoppy/nipoppy#1037 · コメント 1 件 · 2026年6月8日 に作成

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• [MAINT] Refactor pipeline_validation.py into a handler class

  オープン

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  T.1 - Enhancement T.2 - Maintenance

  難易度 4/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

  nipoppy/nipoppy#1031 · 2026年6月5日 に作成

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• [MAINT] Group tests using classes

  オープン

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  T.2 - Maintenance

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 48/100

  nipoppy/nipoppy#1028 · コメント 1 件 · 2026年5月28日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• [MAINT] prevent emphasize-lines drift in docs sample configs

  再び着手できるかも @laurapiro17 が 181 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  stale T.2 - Maintenance

  nipoppy/nipoppy#990 · コメント 4 件 · 担当者 1 名 · 2026年4月21日 に作成

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• [MAINT] Make `DatasetLayout` explicitly part of the public API

  オープン

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  stale T.2 - Maintenance

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  nipoppy/nipoppy#977 · コメント 1 件 · 2026年4月9日 に作成

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• [MAINT] Make `Study` explicitly part of the public API

  オープン

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  stale T.2 - Maintenance

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

  nipoppy/nipoppy#976 · コメント 1 件 · 2026年4月9日 に作成

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• [MAINT] Unified CLI command for `nipoppy run`

  オープン

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  T.2 - Maintenance T.7 - Discussion

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  nipoppy/nipoppy#969 · 2026年4月7日 に作成

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• [MAINT] Combine the workflows for different pipeline types

  オープン

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  Refactoring T.2 - Maintenance T.7 - Discussion

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  nipoppy/nipoppy#968 · 2026年4月7日 に作成

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• [MAINT] Regroup arg for pipeline information

  オープン

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  Refactoring T.2 - Maintenance T.7 - Discussion

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  nipoppy/nipoppy#967 · コメント 1 件 · 2026年4月7日 に作成

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• [MAINT] Refactor the iteration logic for `run_single`

  オープン

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  C.1 - Software Refactoring T.2 - Maintenance

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  nipoppy/nipoppy#966 · 2026年4月7日 に作成

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