networkDynamic for panel of larger networks
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 5/5
- Thời gian dự kiến
- Hơn một tuần
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100
- Loại issue
- Lỗi
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- r
- Lĩnh vực
- performance
Hướng nghiên cứu
Start in R/utilities.R at the networkDynamic() loop referenced around line 628, then investigate whether tergm or sparse sociomatrix operations provide an existing approach for panel networks. Done means converting moderate-to-large panel networks substantially faster while preserving the resulting dynamicNetwork object; benchmark the reported two-network example.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
In the current form, the function networkDynamic() is prohibitively slow for converting a list of panel networks of moderate to large size to a dynamicNetwork object (for example, a list of 2 networks with ~8000 nodes and 16k edges is taking on the order of hours). As far as I can tell, this issue stems from the implementation of a for-loop through all edges of the network here: https://github.com/statnet/networkDynamic/blob/66e66b91418ae6bf55b065d20f92115416cc448e/R/utilities.R#L628.
Based on the comments in the code, I am wondering if tergm or anything else already has a different way of taking on this task that is more efficient. I'm having trouble figuring out where exactly tergm does this, but I think it must do something similar when simulating. Perhaps an operation performed on a stack of sparse sociomatrices would be applicable here?
- Ngôn ngữ chính
- R
- Star
- 12
- Fork
- 1
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của statnet/networkDynamic
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
statnet/networkDynamic#26 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100
statnet/networkDynamic#15 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
statnet/networkDynamic#14 · 2 bình luận ·
-
Error in Group 1 labelsĐang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100
statnet/networkDynamic#11 · 6 bình luận · 1 reaction ·
Tất cả issue của statnet/networkDynamic
Issue tương tự
-
OG improvementĐang mởbug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
rladies/rladies.github.io#620 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100
rfordatascience/tidytuesday#1089 ·
-
Component: R Type: bug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
apache/arrow#51695 · 1 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
nflverse/nflverse-rosters#102 ·
-
bug priority: should
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
The-Strategy-Unit/nhp_outputs#477 ·