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networkDynamic for panel of larger networks

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
r
Ambito
performance

Direzione di ricerca

Start in R/utilities.R at the networkDynamic() loop referenced around line 628, then investigate whether tergm or sparse sociomatrix operations provide an existing approach for panel networks. Done means converting moderate-to-large panel networks substantially faster while preserving the resulting dynamicNetwork object; benchmark the reported two-network example.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

In the current form, the function networkDynamic() is prohibitively slow for converting a list of panel networks of moderate to large size to a dynamicNetwork object (for example, a list of 2 networks with ~8000 nodes and 16k edges is taking on the order of hours). As far as I can tell, this issue stems from the implementation of a for-loop through all edges of the network here: https://github.com/statnet/networkDynamic/blob/66e66b91418ae6bf55b065d20f92115416cc448e/R/utilities.R#L628.

Based on the comments in the code, I am wondering if tergm or anything else already has a different way of taking on this task that is more efficient. I'm having trouble figuring out where exactly tergm does this, but I think it must do something similar when simulating. Perhaps an operation performed on a stack of sparse sociomatrices would be applicable here?

Lingua principale
R
Stelle
12
Fork
1
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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