accelerate the optimization algorithm in stacking
@yao-yl đang làm issue này rồi.
Từ ngày 30/8/2019.
Đánh giá
Issue này chưa được đánh giá.
Mô tả
stacking_weights() optimize the weights, which is a (K-1) simplex. Currently, it renders the constrained optimization and optimizes the first (K-1) weights in a constraint space. When the number of models is large, it is slow (e.g., more than 10 minutes for 10000 models * 100 data)
I did some experiment and found it would be much quicker if it transformed the simplex in the unconstrained space first (several seconds for the same task above). The easiest way is to call optimizing() in rstan and it does the transformation automatically. It also makes it easier if we need extra prior on weights.
@jgabry What is a good way to execute a pre-compiled stan object, without making the whole package dependent on rstan?
- Ngôn ngữ chính
- R
- Star
- 157
- Fork
- 38
- Merge trung bình
- 4 ngày 16 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 2
Hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của stan-dev/loo
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
-
Extend loo_plot_difference Đang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100
-
Clean up issues Đang mở
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
briandconnelly/airnow#9 ·
-
Copy cohorts to keep old cohorts Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
OHDSI/CohortConstructor#774 ·
-
pre-review R TeX Track: 5 (DSAIS)
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 60/100
openjournals/joss-reviews#11330 · 7 bình luận ·
-
Release autosync 0.1.1 Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100