Speed up cupy with custom kernels

Đang mở

#59 mở ngày 11/3/2025 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó: 4/5
Thời gian dự kiến: 3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới: 42/100

Loại issue: Tái cấu trúc
Độ rõ ràng: Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động: Đình trệ
Công nghệ: python
Lĩnh vực: performance

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu với src/rapids_singlecell/preprocessing/_kernels/_mean_var_kernel.py và src/rapids_singlecell/preprocessing/_kernels/_sparse2dense.py, sau đó so sánh các kernel hiện tại với hỗ trợ CuPy được giới thiệu trong #51. Công việc được xem là hoàn tất khi sum, mean_var và các thao tác liên quan chạy nhanh hơn với các kernel tùy chỉnh.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

type: cupy

rapids-singlecell has some CuPy kernels for sum, mean_var, and so on.

Our current CuPy support as of #51 is probably much slower.

Ngôn ngữ chính: Python
Star: 15
Fork: 5
Merge trung bình: 10 giờ 33 phút
Pull request đã merge (30 ngày): 9

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Bắt đầu từ đâu

Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của scverse/fast-array-utils

Document `numba` sparse plugin types Đang mở

Độ khó 1/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 74/100

scverse/fast-array-utils#165 · Mở ngày 9/4/2026
Why does fau need to know about numba internals for thread layer Đang mở

Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100

scverse/fast-array-utils#215 · 1 bình luận · Mở ngày 18/9/2026
More `jit` options, specifically `nogil=True` on the serial kernels Đang mở

Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 65/100

scverse/fast-array-utils#213 · 4 bình luận · Mở ngày 17/9/2026
fork() called from a process already using GNU OpenMP, this is unsafe. Đang mở

Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

scverse/fast-array-utils#179 · 23 bình luận · Mở ngày 24/6/2026
More precise mean_var for non-Dask dense arrays? Đang mở

type: numpy/scipy

Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

scverse/fast-array-utils#128 · Mở ngày 17/10/2025

Tất cả issue của scverse/fast-array-utils

Issue tương tự

PlaywrightRasterizer sizes the viewport from the root attributes, ignoring an inline style Đang mở

bug priority:low

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 76/100

CyberAgent/psd2svg#436 · Mở ngày 25/9/2026
[Bug]: Linux launcher entry doesn't claim the window's app id — dock/taskbar shows a placeholder icon Đang mở

area/install-update comp/cli comp/desktop P3 sweeper:risk-compatibility type/bug

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 86/100

NousResearch/hermes-agent#122386 · 1 bình luận · Mở ngày 25/9/2026
Symbol truncation can split multi-byte UTF-8 runes and cause valid profiles to be rejected Đang mở

ai-generated

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100

grafana/pyroscope#5691 · Mở ngày 25/9/2026
Router doesn't proxy /reset_prefix_cache, unlike /sleep//wake_up//is_sleeping Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100

vllm-project/production-stack#1105 · Mở ngày 25/9/2026
hookify: hooks decode stdin with the Windows ANSI codepage — non-ASCII payloads silently corrupt and block rules fail open Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100

anthropics/claude-plugins-official#6306 · Mở ngày 25/9/2026

Thêm issue về Python