Bubble sizes out of order, when using a formula for the `color`/`name` attributes

Đang mở

#2,346 mở ngày 6/4/2024 2 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó: 4/5
Thời gian dự kiến: 3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới: 35/100

Loại issue: Lỗi
Độ rõ ràng: Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động: Đình trệ
Công nghệ: r
Lĩnh vực: data-visualization

Hướng nghiên cứu

Không có tệp nguồn hoặc bài kiểm thử nào được nêu tên. Bắt đầu bằng cách chạy các ví dụ plot_ly được cung cấp với các giá trị màu formula và tĩnh, sau đó truy vết cách dữ liệu marker size, color và name được ghép lại. Được xem là hoàn tất khi kích thước bong bóng vẫn được căn chỉnh với các hàng ban đầu qua các ngưỡng và trường hợp name được báo cáo, cùng với độ bao phủ hồi quy cho các ví dụ.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Hi folks, I'm seeing a strange effect on scatter plot marker sizes, when using a formula for the color (and name) attributes.

(edited to add more test cases)

library(plotly)
#> Loading required package: ggplot2
#> 
#> Attaching package: 'plotly'
#> The following object is masked from 'package:ggplot2':
#> 
#>     last_plot
#> The following object is masked from 'package:stats':
#> 
#>     filter
#> The following object is masked from 'package:graphics':
#> 
#>     layout

df <- data.frame(x = c(1, 2, 3, 4, 5),
                 y = c(1, 2, 3, 4, 5),
                 z = c(1, 2, 3, 4, 5))

# Expected output: marker sizes in order
plot_ly(df,
        x = ~x,
        y = ~y,
        type = "scatter",
        mode = "markers",
        marker = list(size = ~z,
                      sizeref = 0.1),
        color = ~z < 2,
        colors = c(I("green"), I("red")),
        text = ~paste0("z: ", z))


# df has correct data
df
#>   x y z
#> 1 1 1 1
#> 2 2 2 2
#> 3 3 3 3
#> 4 4 4 4
#> 5 5 5 5

# Buggy output: changing "color" formula threshold puts marker sizes out of order
plot_ly(df,
        x = ~x,
        y = ~y,
        type = "scatter",
        mode = "markers",
        marker = list(size = ~z,
                      sizeref = 0.1),
        color = ~z < 3,
        colors = c(I("green"), I("red")),
        text = ~paste0("z: ", z))


# df still has correct data
df
#>   x y z
#> 1 1 1 1
#> 2 2 2 2
#> 3 3 3 3
#> 4 4 4 4
#> 5 5 5 5

# Buggy output: static vector also puts marker sizes out of order
plot_ly(df,
        x = ~x,
        y = ~y,
        type = "scatter",
        mode = "markers",
        marker = list(size = ~z,
                      sizeref = 0.1),
        color = c(TRUE, TRUE, FALSE, FALSE, FALSE),
        colors = c(I("green"), I("red")),
        text = ~paste0("z: ", z))


# Buggy output: use ifelse with (TRUE, FALSE)
plot_ly(df,
        x = ~x,
        y = ~y,
        type = "scatter",
        mode = "markers",
        marker = list(size = ~z,
                      sizeref = 0.1),
        color = ~ifelse(z < 3, TRUE, FALSE),
        colors = c(I("green"), I("red")),
        text = ~paste0("z: ", z))


# Possible workaround: use ifelse with (1, 0)
plot_ly(df,
        x = ~x,
        y = ~y,
        type = "scatter",
        mode = "markers",
        marker = list(size = ~z,
                      sizeref = 0.1),
        color = ~ifelse(z < 3, 1, 0),
        colors = c(I("green"), I("red")),
        text = ~paste0("z: ", z))


# Buggy again when adding "name" field with formula
plot_ly(df,
        x = ~x,
        y = ~y,
        type = "scatter",
        mode = "markers",
        marker = list(size = ~z,
                      sizeref = 0.1),
        color = ~ifelse(z < 3, 1, 0),
        colors = c(I("green"), I("red")),
        name = ~ifelse(z < 3, "Red", "Green"),
        text = ~paste0("z: ", z))

^{Created on 2024-04-06 with reprex v2.1.0}

Session info

sessioninfo::session_info()
#> ─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
#>  setting  value
#>  version  R version 4.3.3 (2024-02-29)
#>  os       Ubuntu 22.04.4 LTS
#>  system   x86_64, linux-gnu
#>  ui       X11
#>  language (EN)
#>  collate  en_US.UTF-8
#>  ctype    en_US.UTF-8
#>  tz       America/Indiana/Vevay
#>  date     2024-04-06
#>  pandoc   3.1.1 @ /usr/lib/rstudio/resources/app/bin/quarto/bin/tools/ (via rmarkdown)
#> 
#> ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
#>  package     * version date (UTC) lib source
#>  callr         3.7.5   2024-02-19 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  cli           3.6.2   2023-12-11 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  colorspace    2.1-0   2023-01-23 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  crosstalk     1.2.1   2023-11-23 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  curl          5.2.0   2023-12-08 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  data.table    1.15.0  2024-01-30 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  digest        0.6.34  2024-01-11 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  dplyr         1.1.4   2023-11-17 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  ellipsis      0.3.2   2021-04-29 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  evaluate      0.23    2023-11-01 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  fansi         1.0.6   2023-12-08 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  farver        2.1.1   2022-07-06 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  fastmap       1.1.1   2023-02-24 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  fs            1.6.3   2023-07-20 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  generics      0.1.3   2022-07-05 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  ggplot2     * 3.5.0   2024-02-23 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  glue          1.7.0   2024-01-09 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  gtable        0.3.4   2023-08-21 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  highr         0.10    2022-12-22 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  htmltools     0.5.7   2023-11-03 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  htmlwidgets   1.6.4   2023-12-06 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  httr          1.4.7   2023-08-15 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  jsonlite      1.8.8   2023-12-04 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  knitr         1.45    2023-10-30 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  lazyeval      0.2.2   2019-03-15 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  lifecycle     1.0.4   2023-11-07 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  magrittr      2.0.3   2022-03-30 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  munsell       0.5.0   2018-06-12 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  pillar        1.9.0   2023-03-22 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  pkgconfig     2.0.3   2019-09-22 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  plotly      * 4.10.4  2024-01-13 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  processx      3.8.3   2023-12-10 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  ps            1.7.6   2024-01-18 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  purrr         1.0.2   2023-08-10 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  R.cache       0.16.0  2022-07-21 [1] CRAN (R 4.3.1)
#>  R.methodsS3   1.8.2   2022-06-13 [1] CRAN (R 4.3.1)
#>  R.oo          1.26.0  2024-01-24 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  R.utils       2.12.3  2023-11-18 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  R6            2.5.1   2021-08-19 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  reprex        2.1.0   2024-01-11 [1] CRAN (R 4.3.3)
#>  rlang         1.1.3   2024-01-10 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  rmarkdown     2.25    2023-09-18 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  rstudioapi    0.15.0  2023-07-07 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  scales        1.3.0   2023-11-28 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  sessioninfo   1.2.2   2021-12-06 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  styler        1.10.2  2023-08-29 [1] CRAN (R 4.3.1)
#>  tibble        3.2.1   2023-03-20 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  tidyr         1.3.1   2024-01-24 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  tidyselect    1.2.0   2022-10-10 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  utf8          1.2.4   2023-10-22 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  vctrs         0.6.5   2023-12-01 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  viridisLite   0.4.2   2023-05-02 [1] CRAN (R 4.3.0)
#>  webshot       0.5.5   2023-06-26 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  withr         3.0.0   2024-01-16 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  xfun          0.42    2024-02-08 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  xml2          1.3.6   2023-12-04 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>  yaml          2.3.8   2023-12-11 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> 
#>  [1] /home/jonathan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.3
#>  [2] /usr/local/lib/R/site-library
#>  [3] /usr/lib/R/site-library
#>  [4] /usr/lib/R/library
#> 
#> ──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────

Bad color formulas are:

z < 3
z < 4
z < 5

The results from z < 2 may also be incorrect ... they're just indiscernible given my example.

This behavior causes significant skewing/confusion for bubble plots of any size.

Thanks for reading!

Ngôn ngữ chính: R
Star: 2.7k
Fork: 641
Chỉ số merge pull request: Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Hướng dẫn đóng góp

Mở hướng dẫn đóng góp

Bắt đầu từ đâu

Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của plotly/plotly.R

subplot() fails to plot 6 plots in a 2 rows x 4 columns grid Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 62/100

plotly/plotly.R#2400 · 2 bình luận · Mở ngày 1/11/2024
geom_GeomInteractiveSegment() has yet to be implemented in plotly Đang mở

Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

plotly/plotly.R#2499 · Mở ngày 15/9/2026
libcurl error when using htmlwidgets::saveWidget along with plotly::partial_bundle without an internet connection Đang mở

Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100

plotly/plotly.R#2498 · Mở ngày 26/8/2026
Data gets dropped in add_trace and consequently points have the wrong color if NA is present Đang mở

Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 72/100

plotly/plotly.R#2497 · 3 bình luận · Mở ngày 19/8/2026
save_image Error Đang mở

Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

plotly/plotly.R#2494 · Mở ngày 25/6/2026

Tất cả issue của plotly/plotly.R

Issue tương tự

[Bug]: Right-eyed flounder images display backwards Đang mở

bug triage_needed

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100

nmfs-ost/asar#574 · Mở ngày 22/9/2026
Add `<thead>` and `<tbody>` tags into output of `as_html` Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100

pharmaverse/rtables#1123 · 1 bình luận · Mở ngày 22/9/2026
Bug in EMLeditor::set_permissions Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100

DOI-NPS/EMLeditor#234 · Mở ngày 22/9/2026
Incorrect coaches in games.csv Đang mở

Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 85/100

nflverse/nflreadr#326 · Mở ngày 22/9/2026
Trying to reassign a reactiveVal to the name of an existing reactiveVal doesn't overwrite the latter Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100

rstudio/shiny#4432 · Mở ngày 22/9/2026

Thêm issue về R