Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

[Feature]: Multivariate-Tweedie for age/length compositional likelihood

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#266 34 bình luận 0 reaction 1 người được giao Xem trên GitHub

@iantaylor-NOAA đang làm issue này rồi.

Từ ngày 7/3/2022.

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Mô tả

composition Epic: Data weighting improvement FIMS in progress statistics wishlist

I'm leading a paper with Tim Miller and Brian Stock, introducing a new "multivariate-Tweedie" likelihood for fitting age/length composition data. It is essentially a more flexible alternative to the Dirichlet-multinomial, and appears to have some useful pros and cons relative to the DM. It internally relies upon a dtweedie likeliood, which Johnoel is adding the ADMB-13, so it should be feasible to implement in SS3 by this summer.

Does anyone have sufficient time and interest to work with me to get it implemented (both in logical code, and with a thoughtful user-interface) in SS3?

[Edit: task list below added by Ian on March 24.]
To-do list for MV Tweedie likelihood based on comments above:

  • create new MV-Tweedie-complike branch to host changes code
  • add new likelihood calculation to SS_objfun.tpl and create a pull request (#278)
  • wait until ADMB 13 is released which will include the dtweedie function: https://github.com/admb-project/admb/issues/234
  • double check likelihood calculation added to SS_objfun.tpl by @James-Thorson-NOAA
  • see what parameters need to be created in SS_readdata_330.tpl
  • name parameters in SS_readcontrol_330.tpl (two for mvtweedie compared with one for DM)
  • check everything else is handled automatically (reporting and write_ssnew)
  • document the changes in the SS3 User Manual
  • apply any parallel changes to DM likelihood (discussed in #185 and #219)
  • modify r4ss to work with models that use MV Tweedie
Ngôn ngữ chính
C++
Star
46
Fork
20
Merge trung bình
2 ngày 6 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
1

Chuẩn bị môi trường

Mở trong Codespaces

Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của nmfs-ost/ss3-source-code

Tất cả issue của nmfs-ost/ss3-source-code

Issue tương tự

Thêm issue về C++

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.