Chủ sở hữu

nextflow-io

Đăng nhập để theo dõi

Đã lập chỉ mục 22 kho mã nguồn · Xem trên GitHub

Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • Windows built for the PyPI package
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 85/100

    nextflow-io/tree-sitter-nextflow#54 ·

  • Azure Batch: autoscale pool whose first resize fails scales to zero and never grows
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 49/100

    nextflow-io/nextflow#8086 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Could we get PyPI releases back?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nextflow-io/tree-sitter-nextflow#50 ·

  • URL validation stalls when nextflow is run in offline mode
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 56/100

    nextflow-io/nf-schema#244 · 1 bình luận ·

  • Lineage: record the S3 object version ID for input files
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    storage/aws

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    nextflow-io/nextflow#8031 · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • SummaryCreator#maybeMask fails with ambiguous overloading on null parameters since 2.7.3
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 65/100

    nextflow-io/nf-schema#240 ·

  • Add Fractional Accelerator Requirements
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    nextflow-io/nextflow#7947 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Regression: nf-tower omits workflow completion PUT after workflow-level errors in Nextflow 26.04.4
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    nextflow-io/nextflow#7937 · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Plugin commands cannot apply `-profile`, and plugins built against 26.04 fail on 26.10
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    plugins

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nextflow-io/nextflow#7900 · 1 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • splitFasta reads every file as gzip after the first .gz file
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100

    nextflow-io/nextflow#7878 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Cached process weblog hits
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nextflow-io/nf-weblog#17 ·

  • paramsSummaryLog: cannot cast String to Map
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    nextflow-io/nf-schema#239 · 10 bình luận ·

  • nf-k8s: Suggestion - treat a 409 AlreadyExists during job/pod creation as successful
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nextflow-io/nextflow#7864 · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Type checker: `null` element in a list literal reported as an inconsistent element type
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug triage/investigate

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 72/100

    nextflow-io/nextflow#7854 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Workflow emit of a `def` local variable fails with "Missing workflow output parameter"
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug triage/investigate

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 54/100

    nextflow-io/nextflow#7844 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Google batch "Read timed out" error when collecting output files, causes successful jobs to incorrectly count as a failure.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    nextflow-io/nextflow#7824 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [documentation] How to "module run" on multiple sample files ?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    docs lang/modules

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 55/100

    nextflow-io/nextflow#7817 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • nf-google: relax minimal version
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    executor/google-batch

    Độ khó 3/5 Nửa ngày Mức phù hợp với người mới 40/100

    nextflow-io/nextflow#7810 · 4 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • On abort, onFlowComplete and workflow.onComplete run before onError, and a strict-syntax onError: handler fails to run
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    nextflow-io/nextflow#7784 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • absolute path in rocrate
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    nextflow-io/nf-prov#61 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • nextflow lint - add CLI flag to warn/fail on use of .view and .dump operators
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100

    nextflow-io/nextflow#7765 · 4 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Feature request: use `ParamSubstitution` in `default` field
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    nextflow-io/nf-schema#228 · 1 reaction ·

  • Officially allow merging of plugin blocks in configuration
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    lang/config plugins

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 45/100

    nextflow-io/nextflow#7724 · 3 bình luận · 6 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Publishing a non-work-directory file with `>>` in a dynamic path closure throws NPE in PublishOp.getTaskDir
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    triage/investigate

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 65/100

    nextflow-io/nextflow#7667 · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Consistent hangs on "Waiting for file transfers to complete (1 files)" on CephFS/K8S
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    executor/k8s

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    nextflow-io/nextflow#7666 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • TaskHasher folds the evaluated task.ext.* value, putting task.cpus back in the task hash
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 74/100

    nextflow-io/nextflow#7663 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • nf-tower: interactive auth prompts hang or fail when stdin is not a terminal
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 74/100

    nextflow-io/nextflow#7642 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • nextflow 26.04.x+ incompatible with LSF 10.1.0, Stopping a head job fails to stop compute jobs.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    executor/lsf triage/investigate

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100

    nextflow-io/nextflow#7640 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Globstar output patterns may result in invalid move operations when `scratch = true` and `stageOutMode = move`
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    triage/investigate

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 58/100

    nextflow-io/nextflow#7637 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Google Batch: Fusion scratch mount omitted for machines with built-in Local SSDs (-lssd)
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    executor/google-batch storage/fusion

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 74/100

    nextflow-io/nextflow#7627 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Feature request: periodic progress logging during samplesheet validation
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nextflow-io/nf-schema#224 · 2 bình luận ·

  • Translation pipeline can write invalid/corrupted output when updating against an existing translation (duplicate frontmatter, leaked LLM preamble, broken YAML)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 78/100

    nextflow-io/training#985 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Basic architecture awareness when using singularity/apptainer - container image name
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 50/100

    nextflow-io/nextflow#7617 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Basic architecture awareness when using singularity/apptainer - pulling
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100

    nextflow-io/nextflow#7616 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Hello Nextflow workflow image
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    hello series

    nextflow-io/training#978 · 2 bình luận · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • PBSPro executor spamming PBS server with requests
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    executor/pbs executor/pbspro

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100

    nextflow-io/nextflow#7535 · 4 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • AWS Batch: expose the job-termination rate limit as real config instead of reusing executor.submitRateLimit (and an internal pool name)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    executor/aws-batch

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nextflow-io/nextflow#7502 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add a rename method for records
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    nextflow-io/nextflow#7473 · 1 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • ci: automate registry and GitHub releases from one tag
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 62/100

    nextflow-io/nf-trino#12 ·

  • fix: support or remove documented JDBC connection properties
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    nextflow-io/nf-trino#11 ·

  • docs: align testing guidance with actual test tiers
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 72/100

    nextflow-io/nf-trino#10 ·

  • test: make runnable fixtures fail closed
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    nextflow-io/nf-trino#9 ·

  • fix: import the SQL extension from nf-trino
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 72/100

    nextflow-io/nf-trino#8 ·

  • Publish the 0.7.1 Maven artifact for downstream plugins
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 46/100

    nextflow-io/nf-sqldb#33 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Legacy Groovy style typing is silently ignored
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    triage/investigate

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    nextflow-io/nextflow#7438 · 4 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Allow groupBy for records with a specific key
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    lang/dataflow

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    nextflow-io/nextflow#7422 · 7 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Bad cancelation for cache db
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nextflow-io/nextflow#7421 · 3 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • -stub before another option (not directly before the pipeline arg) resolves wrong pipeline (nextflow-io/true)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    triage/investigate

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    nextflow-io/nextflow#7419 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Boolean parameter validation failure in nf-core/rnaseq 3.26.0 with Nextflow 26.04
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    nextflow-io/nextflow#7411 · 1 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Misleading error message when using shadowed process name in map
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    triage/investigate

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nextflow-io/nextflow#7397 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Đang hiển thị 100 mục mới nhất

Trang này chỉ liệt kê những gì được lập chỉ mục gần đây. Bộ lọc nâng cao có toàn bộ kho, thu hẹp theo ngôn ngữ, độ khó và thời lượng.

Mở bộ lọc nâng cao

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.