Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

Error with customized dataset

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#147 2 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức phù hợp với người mới
35/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
python
Lĩnh vực
machine-learning

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu trong graphormer/tasks/graph_prediction.py, đặc biệt là __import_user_defined_datasets, và so sánh nó với giá trị --user-data-dir trong lệnh shell được cung cấp. Kiểm tra cách module customized_dataset được kỳ vọng là sẽ được phát hiện, sau đó chạy lại lệnh; hoàn tất khi quá trình huấn luyện tiếp tục mà không gặp ModuleNotFoundError đã báo cáo.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Hallo everone,
I wanted to train a customized dataset. Following the instructions in https://graphormer.readthedocs.io/en/latest/Datasets.html#id5
I added my code before the create_customized_dataset function to build a dgl dataset class. Then I wrote a shell file to run the training process. But I got ModuleNotFoundError error when I started the training.
Here was the error information

Traceback (most recent call last):
  File "/root/anaconda3/envs/graphormer/bin/fairseq-train", line 8, in <module>
    sys.exit(cli_main())
  File "/root/anaconda3/envs/graphormer/lib/python3.9/site-packages/fairseq_cli/train.py", line 528, in cli_main
    distributed_utils.call_main(cfg, main)
  File "/root/anaconda3/envs/graphormer/lib/python3.9/site-packages/fairseq/distributed/utils.py", line 369, in call_main
    main(cfg, **kwargs)
  File "/root/anaconda3/envs/graphormer/lib/python3.9/site-packages/fairseq_cli/train.py", line 85, in main
    task = tasks.setup_task(cfg.task)
  File "/root/anaconda3/envs/graphormer/lib/python3.9/site-packages/fairseq/tasks/__init__.py", line 46, in setup_task
    return task.setup_task(cfg, **kwargs)
  File "/workspace/Graphormer/graphormer/tasks/graph_prediction.py", line 179, in setup_task
    return cls(cfg)
  File "/workspace/Graphormer/graphormer/tasks/graph_prediction.py", line 142, in __init__
    self.__import_user_defined_datasets(cfg.user_data_dir)
  File "/workspace/Graphormer/graphormer/tasks/graph_prediction.py", line 165, in __import_user_defined_datasets
    importlib.import_module(module_name)
  File "/root/anaconda3/envs/graphormer/lib/python3.9/importlib/__init__.py", line 127, in import_module
    return _bootstrap._gcd_import(name[level:], package, level)
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 1030, in _gcd_import
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 1007, in _find_and_load
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 984, in _find_and_load_unlocked
ModuleNotFoundError: No module named 'customized_dataset'

Here was the shell file

#!/usr/bin/env bash

CUDA_VISIBLE_DEVICES=0 fairseq-train \
--user-dir ../../graphormer \
--user-data-dir /workspace/Graphormer/examples/customized_dataset \
--num-workers 16 \
--ddp-backend=legacy_ddp \
--dataset-name MonomerTg_dataset \
--task graph_prediction \
--criterion l1_loss \
--arch graphormer_slim \
--num-classes 1 \
--attention-dropout 0.1 --act-dropout 0.1 --dropout 0.0 \
--optimizer adam --adam-betas '(0.9, 0.999)' --adam-eps 1e-8 --clip-norm 5.0 --weight-decay 0.01 \
--lr-scheduler polynomial_decay --power 1 --warmup-updates 60000 --total-num-update 400000 \
--lr 2e-4 --end-learning-rate 1e-9 \
--batch-size 64 \
--fp16 \
--data-buffer-size 20 \
--encoder-layers 12 \
--encoder-embed-dim 80 \
--encoder-ffn-embed-dim 80 \
--encoder-attention-heads 8 \
--max-epoch 10000 \
--save-dir ./ckpts

Anyone knows why it happens and maybe a solution for it?
Thank you very much!

Ngôn ngữ chính
Python
Star
2.5k
Fork
374
Merge trung bình
14 giờ 51 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
3

Chuẩn bị môi trường

Chúng tôi chưa kiểm tra các tệp thiết lập môi trường của dự án này. Hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của microsoft/Graphormer

Tất cả issue của microsoft/Graphormer

Issue tương tự

Thêm issue về Python

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.