Sparse columns
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 5/5
- Thời gian dự kiến
- Hơn một tuần
- Mức phù hợp với người mới
- 25/100
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu bằng việc xem xét dataframe API specification và các tài liệu tham khảo được liên kết về khả năng tương tác của pandas sparse-data, Arrow sparse-tensor và vaex. Xác định liệu đề xuất đã định nghĩa cách biểu diễn cho các cột thưa, giá trị thiếu và giá trị null hay chưa, đồng thời xác định liệu đề xuất thuộc core specification hay một phần mở rộng tùy chọn. Công việc được xem là hoàn tất khi các câu hỏi thiết kế còn bỏ ngỏ đã được giải quyết và ghi lại trong specification.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Should a dedicated API/column metadata to efficiently support sparse columns be part of the spec?
Context
It can be the case than a given column has more more than 99% of its values that are null or missing (or other repeated constant value) and therefore we would waste both memory and computation by using a dedicated memory representation that does not materialize explicitly these repeated values.
Use cases
- efficient computation: e.g. computing the mean and standard deviation of a sparse column with more then 99% of zeros
- efficient computation: e.g. computing the
nanmeanandnanstdof a sparse column with more then 99% are missing - some machine learning estimators have special treatments of sparse columns (e.g. for memory efficient representation of one-hot encoded categorical data), but often they could (in theory) be changed to handle categorical variables using a different representation if explicitly tagged as such.
Limitations
- treating sparsity at the single column levels can be limiting. some machine learning algorithms that leverage sparsity can only do so when considering many sparse columns together as a sparse matrix using a Compressed-Sparse-Rows (CSR) representation (e.g. logistic regression with non-coordinate-based gradient-based solvers (SGD, L-BFGS...) and kernel machines (support vector machines, Gaussian processes, kernel approximation methods...)
- other can leverage sparsity in a column-wise manner, typically by accepting Compressed Sparse Columns (CSC) data (e.g. coordinate descent solvers for the Lasso, random forests, gradient boosting trees...)
Survey of existing support
(incomplete, feel free to edit or comment)
- pandas' columns can efficiently handle sparse data
- arrow has sparse tensors but apparently those cannot be used to represent table columns
- vaex does have some interop capabilities with scipy.sparse matrices but I am not sure what is the sparse memory layout is preserved (maybe @maartenbreddels or @JovanVeljanoski can comment)
Questions:
- Should sparse datastructures be allowed to represent both missingness and nullness or only one of those? (I assume both would be useful as pandas does with the
fill_valueparam) - Should this be some kind of optional module / extension of the main dataframe API spec?
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 106
- Fork
- 22
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của data-apis/dataframe-api
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
data-apis/dataframe-api#363 · 1 bình luận · 8 reaction ·
-
Row ordering design choiceĐang mởAPI design
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
data-apis/dataframe-api#356 · 1 bình luận ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
data-apis/dataframe-api#355 ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
data-apis/dataframe-api#352 ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
data-apis/dataframe-api#351 ·
Tất cả issue của data-apis/dataframe-api
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 74/100
aws-samples/sample-per-model-bedrock#243 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 66/100
FuRongJun-1999/dsh-memory#404 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
bug frontend
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
PennyLaneAI/catalyst#3337 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Workflow.schedule stops when a cron deadline passes before sleepCó thể đã có người làm @HuaTNA đã nhận hôm nay. Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày