Chủ sở hữu

althonos

Đăng nhập để theo dõi

Đã lập chỉ mục 23 kho mã nguồn · Xem trên GitHub

Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • Rebuild pyhmmer on bioconda
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 75/100

    althonos/pyhmmer#106 ·

  • Support for sylph v1.0.0 (incl. two-stage `.syl2db` databases)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    external

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 12/100

    althonos/pysylph#3 · 4 bình luận ·

  • Add ARM wheels to PyPi
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    althonos/pyinfernal#5 ·

  • Support ambiguous amino acids
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    althonos/pyrodigal#82 ·

  • # Sequences with residues outside `FAMSA_ALPHABET` are rejected, and decoding one writes out of bounds Tested against `v0.7.0`, FAMSA `v2.5.2`.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    althonos/pyfamsa#10 ·

  • profile() silently returns an empty sequence when window exceeds peptide length
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    althonos/peptides.py#9 ·

  • @amypickard.x
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 10/100

    althonos/InstaLooter#377 · 1 bình luận ·

  • Windows compatibility
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pyinfernal#2 ·

  • [Feature Request] - Add ability to modify sketch names
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement question

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100

    althonos/pysylph#2 · 1 bình luận ·

  • Adding lightmotif to Bioconda
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/lightmotif#10 · 6 bình luận ·

  • Asterisks makes trimming fail
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 72/100

    althonos/pytrimal#8 ·

  • HMM model load speed
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    althonos/pyhmmer#101 · 2 bình luận ·

  • What is the best way to "fetch" a particular HMM name from a massive pHMM file using `pyhmmer`?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/pyhmmer#100 · 2 bình luận ·

  • cmbuild from pyinfernal?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/pyinfernal#1 ·

  • Genes with internal stop codons predicted from ambiguous bases
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    althonos/pyrodigal#80 ·

  • Paramiko version inconsistency
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 48/100

    althonos/fs.sshfs#62 ·

  • [Question] How to set number of threads for hmmbuild?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pyhmmer#98 · 2 bình luận ·

  • Handling complex coordinates
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pyaragorn#3 ·

  • Add RBS feature line
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100

    althonos/pyrodigal#78 · 1 bình luận · 1 reaction ·

  • Pyrodigal misses a valid CDS in the input FASTA file
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    external

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100

    althonos/pyrodigal#75 · 1 bình luận ·

  • Incorporating a pyrrolysine-encoding translation table (34) into pyrodigal
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/pyrodigal#74 · 1 bình luận ·

  • Load PFM/PWM
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/lightmotif#9 · 1 bình luận ·

  • Stockholm input format
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    althonos/pytrimal#4 · 5 bình luận ·

  • OBO SyntaxError on backslash in xref
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/pronto#236 · 2 bình luận · 2 reaction ·

  • corresponding ORF not called in different isolates despite identical sequence
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    external

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100

    althonos/pyrodigal#68 ·

  • Question about extract columns from hmmsearch domain output
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pyhmmer#82 · 1 bình luận ·

  • Support for circular sequences
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 28/100

    althonos/pyrodigal#67 · 1 bình luận ·

  • support detection of RBS across linear chromosome breakpoint ?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pyrodigal#65 · 20 bình luận · 2 reaction ·

  • Enforce start codon in pyrodigal ORF prediction
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    althonos/pyrodigal#64 · 3 bình luận ·

  • Whether muscle uses multiple threads
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pymuscle5#3 ·

  • is instalooter dead project
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 10/100

    althonos/InstaLooter#374 · 1 bình luận ·

  • Invalid background frequencies
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/lightmotif#7 · 3 bình luận ·

  • Running the hmmsearch
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pyhmmer#79 · 3 bình luận ·

  • Authentication via Kerberos ticket?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    althonos/fs.smbfs#41 ·

  • TypeError when trying to initialise Alignment object using positional argument.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    althonos/pyfamsa#6 · 4 bình luận ·

  • Rust API
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pymuscle5#2 · 1 bình luận ·

  • Parameter to remove insert column in `hmmalign`
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    althonos/pyhmmer#74 ·

  • Return a single TopHits object when passing a single hmm to hmmsearch
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement question

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pyhmmer#73 ·

  • Adding annotations to synonym type declarations yields KeyError: '{http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#}resource
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    althonos/pronto#230 · 1 bình luận ·

  • BUG: `plan7.HMM.validate()` fails to raise exceptions with ill formatted hmm profiles
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug external

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/pyhmmer#69 · 1 bình luận ·

  • isa: DANGLING:123 causes parse error
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/pronto#226 · 4 bình luận ·

  • Support dangling classes
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/pronto#225 · 1 reaction ·

  • Use stricter paths when referring to items
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    althonos/blanket#14 ·

  • Apply cutoffs for domains
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug question

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/pyhmmer#65 · 5 bình luận ·

  • Guess bit_cutoffs in hmmsearch
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    althonos/pyhmmer#64 · 1 reaction ·

  • How to get cross-references descriptions?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pronto#220 · 1 bình luận ·

  • blanket 0.4 + async-trait don't work together
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    althonos/blanket#13 ·

  • An error of type -10810 has occurred. Can't get application chome / firefox (-1728)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    althonos/InstaLooter#373 ·

  • can someone help me?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 20/100

    althonos/InstaLooter#372 ·

  • cannot reproduce example for ```pyhmmer.hmmer.hmmsearch```
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    althonos/pyhmmer#58 · 1 bình luận ·

Đang hiển thị 100 mục mới nhất

Trang này chỉ liệt kê những gì được lập chỉ mục gần đây. Bộ lọc nâng cao có toàn bộ kho, thu hẹp theo ngôn ngữ, độ khó và thời lượng.

Mở bộ lọc nâng cao

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.