Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

Handle similar model criterion values

Đang mở
#34 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
5/5
Thời gian dự kiến
Hơn một tuần
Mức phù hợp với người mới
25/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
python
Lĩnh vực
data

Hướng nghiên cứu

No file, test, or entry point is named. Start by locating the forward-search and model-selection implementation, then clarify which handling option is wanted; done requires an agreed behavior for near-tied criterion values and coverage for the resulting trajectories or warning.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Models can have indistinguishable criterion values, such that choosing one over the other is determined by numerical noise.

For example, in one case, during a forward search, two models with the same number of parameters were calibrated to have the same likelihood to several decimal places. Repeating the forward search 100 times resulted in 2 different trajectories through model space, occurring approximately 50/50. This is because numerical noise determined which of the two similar models were chosen at this point during the forward search.

Options to handle:

  • emit a warning that it is unclear which model to select, when models are very similar
  • create branches in the model selection, when encountering models that are within some epsilon criterion of each other or the best model so far
  • allow users to restart model selection at specific points, to explore trajectories that might have been chosen given different numerical noise, or were within some epsilon criterion of the best model so far
Ngôn ngữ chính
Python
Star
14
Fork
1
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của PEtab-dev/petab_select

Tất cả issue của PEtab-dev/petab_select

Issue tương tự

Thêm issue về Python

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.