Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

wfdb.io._url.NetFileNotFoundError: 404 Error: Not Found for url: https://physionet.org/files/ecg-arrhythmia/1.0.0/WFDBRecords/01/010/.hea

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#513 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức phù hợp với người mới
35/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
python
Lĩnh vực
data

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu tại wfdb.dl_database trong wfdb/io/record.py và theo dõi quá trình tải xuống qua wfdb/io/download.py và wfdb/io/_url.py. Tái hiện yêu cầu đối với dataset ecg-arrhythmia và kiểm tra cách WFDBRecords/01/010/ được diễn giải. Hoàn thành khi có thể tải xuống dataset mà không yêu cầu đường dẫn .hea bị thiếu.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

import os
import wfdb

for db in wfdb.get_dbs():
    print(db)

def download_dataset_from_physionet(dataset_name: str):
    # https://wfdb.readthedocs.io/en/latest/io.html#module-1
    print(f"Downloading {dataset_name} dataset from PhysioNet...")
    if not os.path.exists("physionet"):
        os.makedirs("physionet")
    if not os.path.exists("physionet/" + dataset_name):
        os.makedirs("physionet/" + dataset_name)
    
    wfdb.dl_database(db_dir=dataset_name,
                     dl_dir=os.path.join(os.getcwd(), "physionet", dataset_name),
                     records='all',
                     annotators='all',
                     keep_subdirs=True,
                     overwrite=False)
    print(f"Downloaded {dataset_name} dataset from PhysioNet!")

# Download the MIT-BIH dataset
download_dataset_from_physionet("mitdb") # This one downloads

# Download the ECG arrhythmia dataset
download_dataset_from_physionet("ecg-arrhythmia") # This one doesn't, see traceback below


...
['ecg-arrhythmia', 'A large scale 12-lead electrocardiogram database for arrhythmia study']
.....

Downloading mitdb dataset from PhysioNet...
Downloading ecg-arrhythmia dataset from PhysioNet...
Generating list of all files for: WFDBRecords/01/010/
Traceback (most recent call last):
  File "I:\nasty\Python_Projects\Healthcare\ECG_Classification_Scholarship_Project\main.py", line 27, in <module>
    download_dataset_from_physionet("ecg-arrhythmia")
  File "I:\nasty\Python_Projects\Healthcare\ECG_Classification_Scholarship_Project\main.py", line 15, in download_dataset_from_physionet
    wfdb.dl_database(db_dir=dataset_name,
  File "C:\Users\chalu\AppData\Local\Programs\Python\Python311\Lib\site-packages\wfdb\io\record.py", line 3065, in dl_database  
    record = rdheader(
             ^^^^^^^^^
  File "C:\Users\chalu\AppData\Local\Programs\Python\Python311\Lib\site-packages\wfdb\io\record.py", line 1847, in rdheader     
    header_content = download._stream_header(file_name, pn_dir)
                     ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  File "C:\Users\chalu\AppData\Local\Programs\Python\Python311\Lib\site-packages\wfdb\io\download.py", line 109, in _stream_header
    content = f.read()
              ^^^^^^^^
  File "C:\Users\chalu\AppData\Local\Programs\Python\Python311\Lib\site-packages\wfdb\io\_url.py", line 581, in read
    result = b"".join(self._read_range(start, end))
             ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  File "C:\Users\chalu\AppData\Local\Programs\Python\Python311\Lib\site-packages\wfdb\io\_url.py", line 474, in _read_range     
    with RangeTransfer(self._current_url, req_start, req_end) as xfer:
         ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  File "C:\Users\chalu\AppData\Local\Programs\Python\Python311\Lib\site-packages\wfdb\io\_url.py", line 168, in __init__        
    self._parse_headers(method, self._response)
  File "C:\Users\chalu\AppData\Local\Programs\Python\Python311\Lib\site-packages\wfdb\io\_url.py", line 214, in _parse_headers  
    raise cls(
wfdb.io._url.NetFileNotFoundError: 404 Error: Not Found for url: https://physionet.org/files/ecg-arrhythmia/1.0.0/WFDBRecords/01/010/.hea

Seems to be trying to find a filename that doesn't exist? When you navigate to https://physionet.org/files/ecg-arrhythmia/1.0.0/WFDBRecords/01/010 there are files in there, but the code is looking for .hea which doesn't exist?

Ngôn ngữ chính
Jupyter Notebook
Star
853
Fork
322
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của MIT-LCP/wfdb-python

Tất cả issue của MIT-LCP/wfdb-python

Issue tương tự

Thêm issue về Data Engineering

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.