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Draw natural bond orbitals (NBO, NLMO, NHO) from NBO's own orbital files

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Avaliação

Dificuldade
5/5
Tempo estimado
Mais de uma semana
Facilidade para iniciantes
18/100
Tipo de issue
Funcionalidade
Clareza
Razoavelmente clara
Status de atividade
Ativa
Stack de tecnologia
c
Domínio
backend, data-visualization

Direção de pesquisa

Start from the ORCA and Gaussian 16 Theory Details, where NBO is already requested, and check how the job's output is read back into the Builder's MO panel. The work is to add NBO's PLOT keyword, parse the AO basis and coefficient files, and map their AO order onto the existing MO surface code. Done means an NBO, NLMO or NHO orbital draws as a surface and its values match Multiwfn. Design decisions are still open, so raise them in the issue before writing code.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Descrição

Aim: after an ORCA or Gaussian 16 job with NBO, show the natural orbitals in the Builder's MO panel and draw them as surfaces, like MOs.

How

  • ORCA and Gaussian 16 Theory Details already request NBO (NBO 6/7, the user's own licensed copy). Add NBO's PLOT keyword so NBO writes its orbital files next to the output (the AO basis and the NBO/NLMO/NHO coefficients in that basis, formats documented in the NBO manual).
  • Read them into orbital sets beside the MOs: NBOs, NLMOs, NHOs, each with NBO's label (BD, LP, BD*, CR, RY …, with the atoms) and occupancy.
  • Draw a selected orbital with the existing MO surface code (the coefficients are in the same AO basis; the AO order must be mapped as for the code's own MOs).

Checks

  • Multiwfn reads the same NBO files: orbital values at grid points and the occupancies must agree number for number.
  • NBOView may be used privately for a visual check; no published comparison.

Licence: ECCE does not ship or run NBO itself; it reads files produced by the user's own licensed NBO run, as the NBO manual's documented formats allow for other programs. Before release, the NBO authors are informed of what ECCE does (the manual asks for contact about interfaces).

Planned for 9.2.0.

Linguagem predominante
C
Estrelas
10
Forks
8
Merge médio
21min
PRs com merge (30d)
1

Preparar o ambiente

Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

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