gridscan processing should determine the y- and z- coordinate axes from ISPyB data rather than using the ID
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Avaliação
- Dificuldade
- 4/5
- Tempo estimado
- 3-5 dias
- Facilidade para iniciantes
- 35/100
- Tipo de issue
- Bug
- Clareza
- Razoavelmente clara
- Status de atividade
- Estagnada
- Stack de tecnologia
- python
- Domínio
- data-engineering
Direção de pesquisa
Comece rastreando o caminho de processamento de gridscan e como os registros de ISPyB DataCollection são ordenados e lidos. Verifique onde omegaStart está disponível e como os centros das coordenadas y e z são atribuídos; considera-se concluído quando as coordenadas permanecem corretas se a xy ou xz DataCollection aparecer primeiro por ID.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
Whilst testing release 1.5.7 of Hyperion, which has changes that adjust the ordering of the xy and xz Data Collections such that either one may be the first DataCollection (as sorted by Data Collection ID) it was found that the zocalo results from grid scan processing came back with the y- and z- coordinates of the centres swapped.
When processing the gridscan data, dlstbx should be using the omegaStart values to determine which gridscan plane comes from which DataCollection.
- Linguagem predominante
- Python
- Estrelas
- 2
- Forks
- 3
- Merge médio
- 1d 14h
- PRs com merge (30d)
- 5
Preparar o ambiente
- Inclui um Dockerfile ou arquivo Docker Compose
- Sem modelo de pull request
- Sem guia de contribuição
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
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