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gridscan processing should determine the y- and z- coordinate axes from ISPyB data rather than using the ID

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python

Direzione di ricerca

Inizia tracciando il percorso di elaborazione di gridscan e il modo in cui i record ISPyB DataCollection vengono ordinati e letti. Verifica dove è disponibile omegaStart e come vengono assegnati i centri delle coordinate y e z; il lavoro è completato quando le coordinate rimangono corrette se la xy o xz DataCollection appare per prima in base all'ID.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Whilst testing release 1.5.7 of Hyperion, which has changes that adjust the ordering of the xy and xz Data Collections such that either one may be the first DataCollection (as sorted by Data Collection ID) it was found that the zocalo results from grid scan processing came back with the y- and z- coordinates of the centres swapped.

When processing the gridscan data, dlstbx should be using the omegaStart values to determine which gridscan plane comes from which DataCollection.

Lingua principale
Python
Stelle
2
Fork
3
Merge medio
1g 14h
PR unite (30g)
5

Preparare l'ambiente

  • Include un Dockerfile o un file Docker Compose
  • Nessun modello di pull request
  • Nessuna guida per i contributori

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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