DiamondLightSource/httomo

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High-throughput tomography pipeline

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Forks: 5
Issues abertas para iniciantes: 0
Issues indexadas: 116
Merge médio: 5d 17h
PRs com merge (30d): 1

Linguagem predominante: Python
Licença: Sem dados de licença
Último push no GitHub: 27/8/2026
Última indexação: 15/9/2026
Guia de contribuição: Sem guia de contribuição
Código de conduta: Sem código de conduta
Labels para iniciantes: Nenhum label para iniciantes indexado

Para iniciantes Tudo

Abertas Todas

116 issues abertas indexadas

Creating pipelines zip archive in docs CI on every push to a PR branch Aberta

ci

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 88/100

DiamondLightSource/httomo#714 · Aberta em 22/4/2026
Revisit if halving of `--max-memory` value is appropriate Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 48/100

DiamondLightSource/httomo#707 · Aberta em 7/4/2026
Failing `save_intermediate_data` method MPI tests Aberta

testing

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

DiamondLightSource/httomo#705 · 1 comentário · Aberta em 2/4/2026
Multiple tmp dirs created but only one used for file-backed dataset store Aberta

framework minor

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 72/100

DiamondLightSource/httomo#699 · Aberta em 30/3/2026
Unnecessary `docs/index.html` file? Aberta

documentation question

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 68/100

DiamondLightSource/httomo#697 · Aberta em 26/3/2026
Function determining dataset store backing incorrectly assumes new numpy array is always created by reader Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 68/100

DiamondLightSource/httomo#693 · Aberta em 24/3/2026
Fragmentation of the global CuPy memory pool Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 30/100

DiamondLightSource/httomo#667 · Aberta em 18/12/2025
Redundant logging of GPU ID in data transfer method Aberta

logging minor

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#658 · Aberta em 5/12/2025
`DataSetBlock` constructor takes some params with padding applied but also takes in the padding value Aberta

framework refactor

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DiamondLightSource/httomo#645 · Aberta em 24/10/2025
Document that block splitter doesn't know about padding when reading blocks Aberta

documentation framework

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#642 · Aberta em 20/10/2025
OutputRef cannot be accessed in a method when padding Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 25/100

DiamondLightSource/httomo#632 · Aberta em 2/10/2025
Incorrect type of `start_offset` and `stop_offset` keys in `StartStopEntry` Aberta

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#611 · Aberta em 28/7/2025
Incorrect type of `start` and `stop` keys in `StartStopEntry` Aberta

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 58/100

DiamondLightSource/httomo#610 · Aberta em 28/7/2025
Incorrect type of key in `StartStopEntry` for representing a key that may not be present Aberta

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 72/100

DiamondLightSource/httomo#609 · Aberta em 25/7/2025
Incorrect type of key in `PreviewParam` for representing a key that may not be present Aberta

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 52/100

DiamondLightSource/httomo#608 · Aberta em 25/7/2025
Inappropriate tuple-like type for `UserDefinedAngles` Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 62/100

DiamondLightSource/httomo#607 · Aberta em 25/7/2025
Inappropriate tuple-like type for `RawAngles` Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 52/100

DiamondLightSource/httomo#606 · Aberta em 25/7/2025
Add ignoring a specific subset of darks and/or flats feature to `StandardTomoLoader` Aberta

enhancement loader

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

DiamondLightSource/httomo#603 · Aberta em 24/7/2025
Handle numpy `_ArrayMemoryError` in reslice `np.concatenate()` call to avoid deadlock in multi-process runs Aberta

bug

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DiamondLightSource/httomo#602 · 3 comentários · Aberta em 17/7/2025
Include MPI process rank in exception log messages Aberta

logging minor

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#601 · Aberta em 17/7/2025
Validate fields given in `preview` loader parameter Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

DiamondLightSource/httomo#597 · Aberta em 4/6/2025
Some UI layer tests take longer than expected to run Aberta

testing

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 42/100

DiamondLightSource/httomo#593 · Aberta em 28/5/2025
Failing conda env creation command in installation docs Aberta

bug documentation

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 48/100

DiamondLightSource/httomo#591 · 2 comentários · Aberta em 20/5/2025
Pascal case instance attribute in `UiLayer` Aberta

minor

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 58/100

DiamondLightSource/httomo#589 · Aberta em 15/5/2025
Document pipeline transformations applied by `UiLayer` Aberta

documentation

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 68/100

DiamondLightSource/httomo#585 · Aberta em 15/5/2025
UI layer test name lacks information on what it's testing Aberta

testing

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#584 · Aberta em 15/5/2025
Out of date mention of python pipelines in `UiLayer` docstring Aberta

documentation

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 65/100

DiamondLightSource/httomo#582 · Aberta em 12/5/2025
Inconsistent creation of blocks by test loader compared to real loader Aberta

testing

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#579 · Aberta em 8/5/2025
Code block not rendered in docs Aberta

documentation

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DiamondLightSource/httomo#576 · Aberta em 28/4/2025
Consider removing unused plumbum dependency Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 45/100

DiamondLightSource/httomo#568 · Aberta em 9/4/2025
Some framework tests require tomopy Aberta

testing

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 30/100

DiamondLightSource/httomo#565 · 1 comentário · Aberta em 3/4/2025
Unnecessary `typing_extensions` dev dependency Aberta

packaging

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 38/100

DiamondLightSource/httomo#563 · Aberta em 27/3/2025
Pyright error if `import httomo` used instead of `import httomo.globals` Aberta

minor

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 45/100

DiamondLightSource/httomo#561 · Aberta em 21/3/2025
preview is smaller than the padded data Aberta

bug

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DiamondLightSource/httomo#548 · Aberta em 17/2/2025
Document method wrappers which transform the `auto` value for a parameter Aberta

documentation

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 68/100

DiamondLightSource/httomo#547 · Aberta em 17/2/2025
Unnecessary setting of `parameters["in_file"]` in `UiLayer._setup_loader()` Aberta

minor

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#546 · Aberta em 17/2/2025
Loader factory function doesn't use `MethodRepository` or `module_path` params Aberta

loader

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

DiamondLightSource/httomo#533 · Aberta em 11/12/2024
Old preview syntax in testing pipeline Aberta

minor

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#525 · Aberta em 6/11/2024
YAML with a colon but no space is valid YAML, but produces a string instead of a map Aberta

question

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

DiamondLightSource/httomo#524 · 1 comentário · Aberta em 6/11/2024
fixing versions for dependencies Aberta

question

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 32/100

DiamondLightSource/httomo#518 · 1 comentário · Aberta em 29/10/2024
Potentially confusing print by YAML checker when checking a loader is first in the pipeline Aberta

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#515 · Aberta em 28/10/2024
Revaluate whether `StandardLoaderWrapper` is needed or not Aberta

loader refactor

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DiamondLightSource/httomo#504 · Aberta em 21/10/2024
Sort out inconsistencies and oddities with the loader's YAML template and how a loader is referenced in a pipeline file Aberta

loader refactor

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 30/100

DiamondLightSource/httomo#501 · 1 reação · Aberta em 21/10/2024
Inconsistent docstring format across codebase Aberta

documentation

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DiamondLightSource/httomo#499 · 1 comentário · Aberta em 18/10/2024
`cufft.py` module excluded from API docs Aberta

documentation memory-estimation

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

DiamondLightSource/httomo#498 · Aberta em 18/10/2024
Sphinx docs build in CI produces warning due to import error when importing `httomo.cli` module Aberta

ci documentation

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DiamondLightSource/httomo#495 · 1 comentário · Aberta em 17/10/2024
Unnecessary `nvtx` dependency Aberta

minor

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 55/100

DiamondLightSource/httomo#493 · Aberta em 16/10/2024
Combining `|` and `xp.ndarray` in a type causes warning in sphinx API docs build Aberta

bug documentation

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

DiamondLightSource/httomo#492 · 2 comentários · Aberta em 16/10/2024
Unnecessary list of one element per iteration in loop in YAML checker? Aberta

question refactor

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 35/100

DiamondLightSource/httomo#477 · Aberta em 11/10/2024
Methods without a `side_outputs` field may be unnecessarily included in `method_id_map` Aberta

question refactor

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DiamondLightSource/httomo#475 · Aberta em 10/10/2024

DiamondLightSource/httomo

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